舌咽神经疼可能是血管被压迫、蛛网膜增厚黏连等因素导致的。
舌咽神经痛的主要病因是血管受压，再者，是蛛网膜的加厚和黏连，最重要的有两个原因。例如，若有变形的血管受压于舌咽神经敏感区，会使传导不正常，致使神经兴奋性出现异常升高，因此有疼痛反应。或因各种原因引起局部蛛网膜增厚，使神经根接触周围血管，颈静脉孔区蛛网膜变厚黏连，神经根被固定，四周出现挤压力量时，神经较不能缓冲被挤压，因此引起舌咽神经痛。
舌咽神经痛是一种出现于舌咽神经分布区域的阵发性剧痛，疼痛性质与三叉神经痛很相似，疼痛发生在一侧舌根、咽喉，扁桃体，耳根部及下颌后部，有时以耳根部疼痛为主要表现。
舌咽神经炎是一种舌咽神经的功能障碍性疾病。
人体抵抗力弱，如受凉，劳累，不好好休息，感冒后会让病毒、细菌侵入舌咽神经，引起舌咽神经的炎症水肿，从而引起舌咽神经的功能障碍。病人会出现说话模糊、吞咽困难等症状，或者是口腔和喉咙的疼痛。这种病人通常都是要进行抗感染治疗。还可以通过服用维生素和营养神经的药物来提高自身的免疫力。
舌咽神经痛是一种由舌咽神经受刺激而引发的一种病症，多数患者的病因还不清楚，有的病人会因舌咽神经周围发生肿瘤、感染等病变而导致。
主要是由于舌咽神经痛、舌咽神经痛、神经根缺少髓鞘、血管压迫、继发性舌咽神经痛等。有可能是因为舌咽神经周边的一些血管位置不正常，或者是肿瘤、感染、动脉瘤、茎突过长、多发性动脉硬化等原因引起的，或者是受到了周边组织的刺激，或者是舌咽神经受到了压迫。
一般情况下，舌咽神经痛（又称舌咽神经痛性痉挛），临床较为罕见，指限于舌咽神经感觉支，偶伴迷走神经区，反复刺痛感。对于舌咽神经痛患者来说，主要采用药物治疗，例如卡马西平和苯妥英钠等；如果药物治疗无效，则可考虑通过手术治疗，手术方法包括舌咽神经干切断、咽上神经切断和迷走神经咽部神经切断。患者可以根据自身情况合理选择。
通常来说，舌咽神经痛的症状有很多，具体分析如下：
舌咽神经痛又叫舌咽神经痛的痉挛，这种痉挛在健康的人中发生的概率很低，比一般的疾病要少很多，它的主要症状是在舌咽神经的区域，同时还会出现反复发作的刺痛或者艾灸。它的主要特征是喉咙、耳朵、扁桃腺和舌后的阵发性疼痛。这很有可能是化疗期间对人体造成的不良反应。