吃完肠虫清后并没有什么反应，大多数服用肠虫清后几小时会有驱虫效果，也有少数可能在一周左右才会有驱虫效果出现。一少部分服药以后会出现轻度头晕，头痛，恶心，腹泻，乏力，口干等症状，这是药物的不良反应。
肠虫清可以在晚上睡觉前吃。肠虫清是一种常见的驱虫药物，对于蛔虫、钩虫、蛲虫等肠道易生虫都具有驱除效果，并且药物产生的副作用相对比较少，因此适宜人群比较广泛。在服用肠虫清时应尽量选择在晚上服用，晚上服用肠道中的寄生虫会处于相对安定的状态下，因此在药物发挥作用时寄生虫的反应相对比较轻，不会引起消化系统不适症状，可以更好的发挥药效。在服用药物之后的一段时间最好是进行大便常规检查，以了解肠道寄生虫的消灭状况，对于寄生虫没有完全杀灭的患者，可以在过一段时间后再次服用药物进行治疗。建议到胃肠科检查，在医生的指导下服用药物治疗。日常注意多喝水，避免吃生冷，刺激性食物，多喝牛奶，适当的活动，改善体质。
一般情况下，小孩吃肠虫清有副作用。
孩吃肠虫清大多没有什么严重的不良反应，少数病例有轻度的头痛、头晕、恶心、呕吐、腹泻、口干、乏力等不良反应，是不需要处理的，它是可以自行的消失的，一般不需要特殊治疗，家长平时需要注意宝宝的饮食，均衡营养，同时还需适当带宝宝出门活动，能够促进宝宝身体的新陈代谢，让宝宝更快的生长发育。
肠虫清吃后12小时后见效，肠虫清的杀虫机理是把肚子里的虫子杀死，在肚子里进行分解，虫子会排出体外，但被分解掉，虫子就不会被看到。肠虫清是一种高效低毒的驱虫药，驱虫效果非常明显，主要是减少葡萄糖被寄生虫的吸收量，使寄生虫的糖原减少，阻止ATP的产生，使寄生虫无法在肚子里继续存活和繁殖，肠虫清在临床中主要用于驱蛔虫、鞭虫、圆线虫等。
肠虫清的剂量却规定是两岁以上的儿童都一次服两片。这是因为肠虫清口服后有95％不被人体吸收，24小时内即随粪便排出体外。被吸收的5％会在肝脏内通过代谢后杀灭组织内的幼虫、肠道内的成虫和虫卵，并在48小时内随尿液排出体外。由此可知，肠虫清是一种吸收少、不易在体内蓄积的药物。应用时，往往采用单剂量一次顿服，不需要按体重计算剂量，成人与两岁以上的小儿剂量一样。
一般来说，吃了肠虫清发现怀孕的影响是可能影响胎儿发育。
肠虫清是目前临床上最常见的抗寄生虫药，肠虫清的作用是低毒性，而口服肠虫清对胎儿的生长没有任何的影响。如果孕妇中有寄生虫或虫卵，那么可能会导致胎儿畸形。孕期定期进行排畸检查，可以在妊娠初期服用叶酸片，以防止神经管缺陷畸形。对于这个问题，最保险的办法是先做人工流产，然后停药，检查身体没有寄生虫感染。
