巧克力囊肿属于子宫内膜异位症，巧克力囊肿时会影响卵巢的排卵，导致卵巢的功能破坏，不排卵导致不孕。同时：子宫内膜症还有可能发生盆腔内，输卵管，子宫。卵巢的粘连，导致盆腔内的大部分器官完全粘连。
巧克力囊肿出现月经量少是正常，可能是引起了月经紊乱导致的。巧克力囊肿又称为卵巢内膜异位囊肿，是子宫内膜异位症的一种病变，当月经脱落的子宫内膜碎片随经血逆流输卵管进入盆腔，种植在盆腔，可形成异位囊肿，受雌激素营养，发生周期性的月经出血，使卵巢增大，可出现陈旧性的出血。
月经多会导致内分泌失调，与受凉，熬夜，过度劳累等都会有关系。不要过于紧张，可以暂时观察着看。月经期间注意保暖，多穿衣物，避免着凉，不要碰冷水，不要吃生冷辛辣刺激性食物，勤换卫生巾，保持私处清洁。
月经过少是指，月经周期正常，每次行经天数短于3天，经血量每次不超过20ml。经血量色淡或深。引起月经过少的原因是垂体功能低下，导致卵巢雌激素分泌不足，使子宫内膜增生不够。
巧克力囊肿术后的恢复2到3个月都不等，需要身体的机能状态恢复正常，身体的内分泌才能逐步平衡，巧克力囊肿一般不会明显影响到卵巢功能，所以目前主要是形成规律的生活方式，促进内分泌平衡调理就可以。
术后巧克力囊肿的一年复发率是10-18%，月经不来不一定会导致复发，还是上医院检查比较好，而且不健康的饮食易导致巧克力囊肿的复发。所以在日常饮食中要注意做好饮食调节，保证饮食多样化，及时补充人体所需的维生素及矿物质，多吃水果、蔬菜，增强人体抵抗力，从而可以有效预防巧克力囊肿复发。
