肛瘘是因为肛旁脓肿或手术后留下的后遗症，确定诊断后需要尽快治疗，目前只有手术才能治好。去正规医院肛肠科行手术治疗，术后积极预防感染，积极换药，以免复发。饮食应粗细搭配，少饮浓茶，咖啡，酒类及少进辛辣食物，以减少对肛管的刺激。便后要温水坐浴。
肛瘘应该首选手术才能切除瘘管治好的，及时治疗，养成良好的排便习惯，每日排便后坐浴保持肛门清洁，对预防感染有积极作用。饮食上多吃含蛋白质类食品，如瘦肉，牛肉，蘑菇等。
肛瘘的治疗包括药物治疗和手术治疗。药物治疗只适用于肛瘘围手术期的调理；手术治疗原则为保护肛门功能，处理内口。肛瘘位于内外括约肌附近，所以治疗中应强调弄清内口的部位与外括约肌深部的关系，以避免损伤括约肌而致肛门失禁。
肛瘘是最为常见的肛肠科疾病之一，表现为反复的红肿疼痛。肛门附近有渗出，对病人的健康造成很大的影响，多见于肛周脓肿后。可以到肛肠科就诊，诊断明确以后需要及早手术，平时多吃蔬菜水果，补充维生素，多运动，粗粮保持大便的软化，不能抽烟喝酒。
出现肛瘘要及时治疗。药物治疗是很重要的方面，比如使用洗剂坐浴或者外涂药膏进行治疗。另外可以使用中药治疗，内服之后会起到较好的疗效。除此之外手术治疗也是重要的方面，比如对于肛瘘发作期合并感染的病人可以切开引流治疗。