肛瘘手术后有复发可能性，需要当地正规综合性医院肛肠科检查明确，必要时肛诊等检查，确诊复发必要时进一步手术治疗。忌辛辣刺激食物，饮食清淡，注意肛门清洁卫生，应用消炎膏，抗生素治疗等医院肛肠科检查明确，必要时进一步手术治疗复发肛瘘。
预防肛瘘首先养成良好的排便习惯，每日排便后坐浴保持肛门清洁，对预防感染有积极作用。建立正常的膳食习惯，因肛瘘的发生与湿热有关，对于油腻饮食，可以内生湿热，所以不宜多吃。
肛瘘多为化脓性感染所致，少数为特异性感染，如结核、克罗恩病、溃疡性结肠炎等感染亦可所致。最佳治疗办法可以手术处理。通常术后需要半月到一月时间恢复，手术观察期间一定要注意饮食生活作息，少吃辛辣刺激的食物，少喝酒，多注意局部的卫生清洗，勤换内裤。
肛瘘手术后是会引起复发的情况的，主要是因为内口的处理欠妥，异物的存留，还有可能是因为术中的异物、结扎线、缝合线、棉纱等残留窗口内，为感染的诱因以及术后护理不当，换药时间间隔过长引起复发的情况。
肛瘘通常不会在手术后复发。前提是内外胃必须正确定位，并且必须进行完全切除。必须避免辛辣和刺激性食物，以避免便秘。肛窦炎不会发生。温水坐浴应该每天进行。软食为主，少吃多餐，确保排便顺畅，避免便秘。药物应该口服。
