本来是应该只存在于子宫内，子宫内膜具有根据体内激素水平的变化周期性增殖、脱落而形成月经。子宫内膜出现在别的地方。出现在其他地方的子宫内膜也和处于子宫内的子宫内膜一样，具有周期性增殖、脱落的规律。
需要三个月左右才能治好。巧克力囊肿是子宫囊肿的一种，属于良性病变，会伴随有增生、转移、复发等情况的出现，而且会造成痛经、月经失调等，因此建议还是及早治疗比较好，需要服药三个月左右进行巩固治疗，另外需要随时复查。
巧克力囊肿是会导致不孕的。至少会造成排卵障碍。卵巢巧克力囊肿的形成是由于内膜在卵巢中仍然会出现“经血”症状，但由于在卵巢内无法排出，日积月累就造成了旧血的长期潴留，形成囊包。
复发几率不大。巧克力囊肿术后人的对侧卵巢或同侧卵巢可能有新的病灶，医生又要开始重新用药，甚至有可能要面临再次手术。如果这种病人做过2-3次的手术以后，卵巢体积就会缩小，也就预示着卵巢功能会下降，将来有可能面临早绝经，或者卵巢的抗缪勒氏管激素会下降，卵巢的储备功能下降。
一般手术后两三天就可以下床走动，正常饮食。一般1~3个月就会逐渐恢复正常。巧克力囊肿是由于子宫内膜异位造成的，手术后可以服用短效避孕药进行调理。月经期间注意保暖，避免受凉，经期不能发生性生活，不能坐浴。
巧克力囊肿是需要做手术切除的。当然每个人的病情不同，囊肿的大小和性质也不同。需要在专业的医院做全面的检查之后，医生会根据病情制定全面的合适的手术方案，另外，手术以后，也是要服用一些药物进行辅助恢复的。
