多囊卵巢药物治疗比较好。少吃含饱和脂肪酸与氢化脂肪酸食品，如猪牛羊肉、肥肉、各种家禽及家畜皮、奶油、人工奶油、全脂奶、油炸食物、中西式糕饼；鱼肉、蛋白、豆、坚果是比较好的蛋白质源。
多囊卵巢综合症是最常见的妇科内分泌疾病之一，经治疗后可恢复正常的月经和生育。此病应控制饮食和增加运动降低体重和腰围，可增加胰岛素敏感性，降低胰岛素、睾酮水平，从而恢复排卵及生育功能。另外进行药物治疗来调节月经周期、降低血雄激素水平、改善胰岛素抵抗、诱发排卵等，或者进行手术治疗。
患有多囊卵巢严重的，是用手术治疗的。可以根据自己的实际情况进行卵巢打孔，但由于存在个体差异，不能保证手术后会痊愈，但症状可以改善，一般多囊在怀孕后症状是可以改善的。或是在医生指导下应用药物治疗都可以。
对于病情较轻的Ⅰ型和Ⅱ型多囊卵巢综合征，可以酌情采用药物治疗。具体用药种类、用药时间及其剂量要根据多囊的病因以及病人的康复进度而定。对于病情较重的Ⅲ型多囊卵巢综合征，可采用手术治疗。
治疗多囊卵巢可以采取手术治疗，说是治疗可以减少卵巢中部分颗粒细胞，卵巢间质产生雄激素减少，从而使循环中的雄激素水平降低，进而GnRH降低，引起血清雄激素浓度进一步降低，这也说明卵巢间质亦受垂体卵巢轴调控。