通常来说，慢性肠炎肚子疼吃枯草杆菌二联活菌肠溶胶囊、阿托品、山莨菪素等药。
慢性肠炎肚子疼可能是由于长期的炎症所致的肠神经受到了刺激导致的，可以口服枯草杆菌二联活菌肠溶胶囊等调节肠道菌群的药物，还可以配合阿托品、山莨菪素等解痉镇痛类的药物。平时也要避免食用过多的生冷和辛辣的食品，避免对肠胃造成刺激，导致病情恶化。
能否获得治疗主要取决于引起肠炎的病因。细菌性肠炎通常发病于夏秋季节，进食不洁食物以后引起肠道菌群紊乱，通过及时的补液、以及抗生素治疗调整肠道菌群，通常可以获得治疗，而对于结核性的结肠炎，需要正规的抗结核治疗。
过敏性结肠炎：若患儿对牛奶蛋白过敏，且为母乳喂养，则其母亲需忌食牛奶、鸡蛋、海鲜等，可补充钙粉、维生素D等；配方奶喂养导致的过敏性结肠炎，可选择低敏配方奶粉。不宜食用油炸、油腻、辛辣的食物，还可补充奶制的食物。
拉肚子通常指腹泻。一般情况下，肚子疼、腹泻可能是肠炎，也可能是消化不良等疾病造成的，具体内容如下：
1.肠炎：如果患者患有肠炎，可能会出现腹痛、腹泻、恶心等不适症状，此时，患者可以遵医嘱使用蒙脱石散、肠炎宁片等药物进行治疗。
2.消化不良：大量食用辛辣刺激性食物可能会导致患者出现消化不良的情况，患者可能会有腹痛、腹泻、恶心等症状。患者可以遵医嘱使用多潘立酮片、健胃消食片等药物来进行治疗。
慢性结肠炎可以吃鱼慢性肠炎在饮食上要注意补充蛋白质及维生素。饮食应选用易消化的优质蛋白质食品，如鱼、蛋、豆制品及富含维生素的新鲜嫩叶菜等，鱼类属于优质蛋白，而且容易消化，所以可以吃的。
慢性肠炎是细菌，病毒，真菌或寄生虫引起的小肠和结肠的炎症。表现为腹痛，腹泻，稀水样便或粘液脓血便。小儿肠炎多因不洁东西所引起，故预防最要紧的是食物之清洁及保存安全。
