新生儿黄疸光疗最主要的副作用是对眼睛的伤害，还有对生殖系统的伤害。但是在进行操作的时候，会避免，会用黑布遮住婴儿的眼睛和婴儿的，这样就不会有副作用。
黄疸蓝光原理是利用皮肤能够吸收波段在450纳米到550纳米之间蓝光，促进黄疸的代谢有助于黄疸的恢复。黄疸主要是病理性黄疸与生理性黄疸，生理性黄疸平时多晒太阳，可以缓解。是属于正常现象，不要担心。
新生儿黄疸照蓝光收费是每个小时收费在2-3元，另外住院期间也是有相关的别的费用，比如新生儿暖箱的费用，收费的标准有地区差异，跟当地的经济水平和医院的等级都有关系。
新生儿黄疸照蓝光没有太大的影响。新生儿黄疸指标高主要是使用蓝光射还有口服茵栀黄颗粒来退黄治疗的，也可以输液使用退黄的药物来治疗。主要是避免引起胆红素脑病，或者是核黄疸等严重的并发症。
蓝光照射是治疗新生儿黄疸最有效，副作用最小的一种治疗办法，特别是病理性黄疸，胆红素在蓝光照射下由脂溶性变成水溶性的异构体，容易经肠道排出体外，从而减轻胆红素对神经中枢的损害。新生儿黄疸特别是重度黄疸，最大的危害就是引起胆红素脑病，又称核黄疸，如果不及时有效治疗，远期很容易引起听力下降，牙釉质发育不良，语言运动功能障碍，脑瘫等后遗症。
蓝光是降低黄疸的一种比较简便有效的方法，在光的作用下非结合胆红素就转变为水溶性胆红素，水溶性胆红素增多，这种水溶性胆红素就可以经过尿液和胆汁从体内排出，所以黄疸就下降了。
