甲状腺异常治疗包括选择性放疗或药物治疗，手术治疗。
在许多情况下，甲状腺功能障碍需要治疗。甲状腺功能不全可分为多个病例，因为甲状腺功能检查不是指标。最简单的检测是TSH、FT3和FT4三个指标，需要根据不同指标进行不同的处理。甲状腺功能减退：TSH升高，FT3和FT4降低，原发性甲状腺功能减退常见。在这种情况下，是否需要治疗取决于TSH水平。甲状腺功能亢进症：TSH降低，FT3和FT4升高。常见的是原发性甲状腺功能亢进症，需要抗甲状腺功能亢进症药物治疗。若药物无用可采用碘-131治疗或手术切除部分甲状腺组织。TSH、FT3和FT4升高时，可能是垂体功能亢进。
甲状腺分泌异常必须具体区分是哪种疾病。根据疾病情况的不同，给出的治疗方案也不同，具体如下：
1、患者检测甲状腺激素水平增高，疑似甲状腺功能亢进，应进一步检查甲状腺功能亢进的病因；Graves病需要这样的抗甲状腺治疗，抗甲状腺的药物治疗有两种，甲泼尼龙等咪唑类和丙基硫氧嘧啶等硫脲类。这两种药物都是一种叫做抗甲状腺药物的抑制甲状腺激素合成的药物；
2、甲状腺激素升高是甲状腺炎引起的，一般认为是病毒感染、炎症、甲状腺组织破坏导致甲状腺激素大量释放入血所致的暂时性甲状腺功能亢进症，不需要抗甲状腺药物治疗，需要对症抗病毒治疗。
孕妇甲状腺功能异常是指出现甲状腺功能下降或甲状腺功能下降。
在任何情况下，都必须及时对症治疗，以免影响胎儿的正常发育。具体检查结果如出现异常，应及时治疗。妊娠甲状腺功能异常包括甲状腺功能减退或甲状腺功能减退。不同的疾病，不同的治疗方法。甲状腺功能异常容易引起胎儿畸形，特别是影响智力发育，必须积极治疗。孕妇甲亢口服丙硫氧嘧啶，治疗目标：孕妇轻微甲亢状态或甲状腺功能达到正常上限。孕妇口服左甲状腺激素片，治疗目标为：孕早期TSH0.1—2.5uiu/ml，孕晚期TSH0.2—3.0uiu/ml。
甲状腺功能异常包括甲状腺功能亢进和甲状腺功能减退，甲状腺功能亢进是心慌手抖，出汗多，进食多，消瘦，胃肠道蠕动快等症状，甲状腺功能减退是怕冷，不想说话，心跳减慢，胃肠蠕动减慢，还包括一些水肿的症状。
甲状腺功能包括促甲状腺素(TSH)、甲状腺素(T4)、游离甲状腺素(FT4)、三碘甲状腺原氨酸(T3)、游离三碘甲状原氨酸(FT3)、甲状腺球蛋白抗体(TG)、抗甲状腺过氧化物酶抗体(TPO)。甲状腺功能异常包括很多方面，比较常见的是甲状腺功能亢进症。甲状腺功能亢进症又包括临床型甲亢，此时T3、T4增高，伴有TSH的降低。还包括亚临床甲亢，此时T3、T4正常，但是TSH相应降低。对于甲状腺功能异常，还有甲状腺功能减退症，包括临床型甲减，此时T3、T4降低，TSH增高。还包括亚临床甲减，此时T3、T4正常，但TSH升高。还有甲功三项，T3、T4、TSH均正常，但是伴有TG和TPO抗体的增高，称为自身免疫性甲状腺病。如果甲状腺功能出现异常建议到内分泌科就诊，内分泌科医生会根据功能异常的程度和类型选择适合的治疗方案。
孕期甲状腺功能异常需要及时进行治疗。
孕妇在孕期出现孕期甲状腺功能异常需要及时到医院进行诊断治疗，因为孕妇的孕期甲状腺功能异常容易造成胎儿的发育出现异常，比如智力低下、胎儿畸形等。所以孕妇在确诊甲状腺功能异常后，一定要积极在医生的指导下进行治疗。孕妇在怀孕期间需要定期进行产检、明确自身和胎儿的情况，如果出现异常需及时进行治疗。
