一般情况下，婴儿鼻炎每天凌晨三点咳嗽几声可能是以下原因引起的。具体分析如下：
小儿的鼻炎在凌晨出现咳嗽，很有可能是因为婴幼儿的过敏性鼻炎。也有一些原因是因为婴幼儿的急性鼻炎，这是因为病毒感染所致的鼻粘膜的急性炎性病变，会出现发热、鼻塞、流鼻涕等情况。当鼻液逆向流入咽喉时，会对咽喉粘膜造成一定的刺激，会导致咳嗽等。宝宝早上出现剧烈的咳嗽，也是因为孩子的胃内容物倒灌到了咽喉，会对咽喉粘膜造成一定的刺激。
小孩子的鼻炎不易过度用药治疗可以采取保守的方式进行治疗，日常生活中多给孩子喝一些水保持室内通风换气，并且清理干净孩子的鼻屎。对于特别严重的鼻炎必要的时候也可以考虑使用一些药物进行治疗。
孩子鼻炎常见的症状有鼻塞、流鼻涕。如果是以过敏性因素为主的鼻炎可以鼻痒、流清鼻涕、打喷嚏。另外相对比较重的鼻炎可以合并有头闷、头痛，以及嗅觉下降。如果鼻炎持续时间比较久，还可以导致鼻咽炎和咽鼓管炎，咽鼓管功能紊乱，就可以出现耳闷和听力下降等，这些都需要引起家长的注意。
过敏性鼻炎治疗方法较复杂。药物治疗，需做脱敏检查，根据脱敏检测方案、结果，制定脱敏治疗方案。物理治疗，盐水、中成药物，进行鼻腔冲洗。微创手术治疗，病人出现鼻塞等症状，可微创手术治疗。
小孩子鼻炎需要用一些抗鼻炎的药物，这些药物可以抵抗鼻子中的细菌，还有就是平时一定要清理鼻子，可以用一定的生理盐水来处理，因为生理盐水可以杀菌。局部治疗，如果鼻子堵，可以早期用减充血剂，但是不要时间过长。可以用显著的抗炎作用的、局部的相关药物喷鼻。
