三个月宝宝咳嗽喉咙有痰可能是患支气管炎，在此情况下，应给予患儿口服部分抗生素抗感染，接着还可以在医生的指导下选一些止咳化痰药口服，同时建议再对患儿进行雾化吸入。如果不知道如何使用，可以自己去买一个雾化装置。雾化吸入属局部给药，其副作用相对小，且起效较快，使患儿迅速康复。
此外，三个月宝宝咳嗽喉咙有痰可以适当饮用温热水。
通常情况下，三个月宝宝咳嗽、咳嗽有痰可以通过物理方法、药物来治疗。具体分析如下：
1.物理方法：如果三个月宝宝咳嗽，喉咙有痰，需要勤测体温，当出现发烧的情况，可进行物理降温，如贴降温贴、温水擦浴或者洗温水澡等等。
2.药物：如果三个月宝宝咳嗽有痰，可以使用药物来治疗，比如利巴韦林颗粒、磷酸奥司他韦颗粒、头孢克肟颗粒、阿莫西林颗粒等。
三个月宝宝咳嗽有痰需要给宝宝做雾化吸入，缓解症状，要注意保暖，避免受凉，可以多给宝宝拍下背部，由下往上震动，利于痰液的排出，还可以在不烫伤宝宝皮肤的前提下，热敷没有闭合的前囟门。
宝宝出现咳嗽、咳痰，并且眼部分泌较多的分泌物，常常提示感染因素引起。在护理上，宝宝需要饮食清淡、容易消化的食物，保证充足的睡眠，避免接触有感染，防止再次受到感染，加重病情。药物治疗上，如果存在细菌感染，可以口服药物治疗。
3个月的宝宝咳嗽有痰，此时孩子的年龄比较小，可以将宝宝趴在大人的腿上，不断的叩击宝宝的背部，这样可以达到使痰液松动的作用。每次持续的时间约2-3分钟，对于痰液的排出有一定的帮助。
宝宝咳嗽喉咙有痰可给予小儿肺热咳喘口服液、化痰颗粒等以止咳化痰。也可采取小儿推拿治疗，揉二马，揉板门，逆运内八卦，清肺经，揉小天心，补肾水，夜间咳嗽重者，分推肩甲穴各50次。