流脓：脓液多少与瘘管大小、长短及数目有关。新形成或炎症急性发作期的瘘管脓多、味臭、色黄而浓厚，经久不愈的瘘管脓液较少或时有时无。脓液急剧增多，局部脓肿，体温增高。常因肛瘘炎症急性发作或有支管形成。结核性肛瘘脓液多而清稀，呈米泔水样，可有干酪样坏死物。肿块：肛缘索条状硬块。
内痔出血外痔痛，最常见的就是痔疮。内痔的主要临床表现是出血和脱出。肛裂病人有典型的临床表现，即疼痛、便秘和出血。确定诊断需要做肛门指诊及肛门镜检查。一般治疗：避免久坐，避免辛辣刺激性食物很重要，增加纤维性食物，改变不良的大便习惯，保持大便通畅，防治便秘和腹泻。热水坐浴可改善局部血液循环。肛管内注人油剂或栓剂，有润滑和收敛作用，可减轻局部的疹痒不适症状。
肛瘘的早期症状疼痛瘘管通畅无炎症时，一般无疼痛，只有肛门局部略有肿胀感，行走时可加重，若外口封闭，瘘管存积脓液，或粪便进入瘘管，则会疼痛加重或排粪时疼痛加重，而内盲瘘则常感直肠下部和肛门部灼热不适，排粪时疼痛加重。
一般的肛瘘通过“摸”就能诊断清楚。但如果瘘管位置较深，或没有完全形成，或属于括约肌间的，此时需要采取下面措施继续检查。用探针从肛瘘的外口探入，只要瘘管畅通，探针就可以一直探查到内口。手术时，沿探针把瘘管切开。用探针来定位内口需排除两种状况，瘘管中间闭塞不行，瘘管弯曲不行。
肛瘘是可以出现流血现象的，但是并不严重，因为流血的量并不多，并且经常与脓液一起排出。肛瘘是由位于肛周皮肤的外口以及直肠内的内口，以及连接于两者之间的瘘管所组成。由于瘘管引流通常并不通畅，瘘管内的不健康肉芽组织发生缺血、坏死，可以导致出血，并且与脓液一起从瘘管自外口排出。
