通常采用物理治疗和局部注射药物的方法，具体选用的方法要根据跖疣大小、数目多少，以及肥厚程度，既往治疗情况选择，最适合的方法就是最佳的方法。
患者可以采取物理治疗，比如液氮冷冻、二氧化碳激光等方法治疗，都是比较方便的。如果比较大的、顽固的皮损，还可以采取手术挖除法。
平时少吃辛辣刺激的食物，忌烟酒，保持充足的睡眠，少熬夜。
儿童治疗软疣首先应去除软疣再进行药物治疗，不能自愈。
软疣多数临床表现为白色半球状丘疹或可挤出白色乳状物质。治疗时可刮除疣体或使用镊子将疣体内物质挤出，再外涂碘酊、酞丁安软膏、西多福韦软膏等，也可以使用冷冻疗法等。平时应避免儿童与人共用洗浴用品和毛巾，避免到公共游泳池游泳等。
病毒性疣可呈寻常疣、扁平疣、跖疣、尖锐湿疣。使用最多的主要为物理方法，可通过液氮冷冻治疗或激光灼除等，同时可与抗病毒药物联合应用，常采用干扰素制剂、咪喹莫特等乳膏。
怎样选用液氮冷冻或激光治疗，应视皮疹多少而定，大小、生长位置等。通过规范处理，绝大多数能治愈。
疣多由人类乳头瘤病毒感染引起，可以通过皮肤的微小破损自身接种传染，从而越来越多，是具备传染性的，发现就要尽早治疗。治疗的方法主要有：药物治疗；光动力学疗法，系统或局部外用光敏剂，光照后引起局部细胞死亡，可治疗部分寻常疣、尖锐湿疣；物理疗法，冷冻疗法、电灼疗法、激光治疗、红外凝固治疗适用于数目少的寻常疣和跖疣。个别巨大疣体可行手术切除术。
肛门疣的中医治疗是通过中药在病灶上的皮肤、毛细血管吸收、渗透，达到疣体自然枯萎、脱落的效果。患者可以去皮肤科让医生先检查下，这个需要和痔疮鉴别诊断，然后再对症治疗用药。
