可以通过药物、手术等方式治疗甲亢突眼症。
对于突眼的药物治疗，可以选择强的松等皮质激素，但作用缓慢，病程长，副作用也多。还有一些其它的免疫抑制剂，比如环磷酰氨，也可以起到一定的效果，不过副作用会比较大。除此之外，云克治疗也可以用来改善突眼的症状，但是效果并不是很好。对严重的突眼症可以通过外科手术来进行治疗，但其效果并不明确。对于突眼症较严重的患者，可以采取其它的治疗措施，以减轻眼窝内的压迫，并配合换血疗法。
甲状腺机能亢进是甲状腺激素分泌过多引起的一种内分泌疾病，甲状腺机能亢进的突眼，要以治疗甲亢为主。当甲状腺机能亢进被控制到一定程度时，会消失。平时注意饮食清淡，多进行体育锻炼，多吃蔬菜水果。
甲亢是指甲状腺功能亢进症，甲状腺功能亢进症引起的突眼可能会恢复。
因为在甲状腺功能亢进症期间，交感神经的兴奋引起的，导致眼睛瞬间睁开，眼睛向上抬时额纹不能皱起，造成突眼。在治疗了甲状腺功能亢进症后，突眼就会逐渐消失。如果是恶性突眼，是因为眶后有炎症组织堆积引起，通常会出现眼肌变粗，恶性突眼如果能得到很好的治疗，那么其症状消失。
甲亢突眼能游泳，但建议少游泳。
有甲状腺功能亢进的人不宜去游泳，因为在水中会引起眼睛的炎症，一旦被传染了，就会加剧眼睛的反应。有甲状腺功能亢进的人要在医师的建议下使用眼药水进行保护，病情比较严重时可以使用药物或者外科治疗。出门时要佩戴太阳镜，尽量不要受强烈的光线和沙尘暴的影响，注意控制食盐的摄入量，加强眼部活动。
甲亢突眼若为良性只要保守治疗就可以了，挂内分泌科如果甲亢的突眼为恶性，需手术治疗时，应挂眼科。
如果甲亢突眼不是很严重时，就不需要做什么特殊处理了。甲亢突眼在多数情况下呈良性和自限性，即几年后就能自动减轻，并且突眼消失。如果是甲亢恶性突眼时，就是很严重的，会引起永久性眼压增高，导致眼睛失明或者视网膜脱落等并发症。则象此类甲亢突眼等，仅需内分泌科医生指导1次治疗即可，再定期随访。
