在干扰素治疗期间，有转氨酶升高，可酌情增加检查次数。如果发现转氨酶急剧升高，应考虑减量，如仍有进行性的升高或胆红素升高应停药。可口服一些降酶药，但是需要在指导下服用药物。
用干扰素一般不会影响月经。
干扰素具有增强机体免疫功能，能够有效地排除体内的有害物质，对多种类型的病毒进行辅助处理。高度危险HPV病毒的患者，在TCT检查中没有发现任何问题，在免疫力下降的情况下，可以使用干扰素栓进行阴道上药。干扰素栓不会对女性的卵巢产生任何的干扰，也不会对月经造成任何的负面影响。如果服用了干扰素栓会推迟来潮，那么就需要怀疑是否有别的因素，例如妊娠、压力等。
干扰素一般不会影响月经。由于干扰素被用于提高免疫力，常用于抗病毒治疗，但若再与其他药物合用，由于药物间的相互作用，很可能对月经产生影响，但是干扰素自身并不影响月经。在临床中有许多因素可以影响月经，如妊娠。如果病人有月经不规律，若判断病人未妊娠，很可能月经失调了，由于干扰素对月经没有影响。另外还有一个原因就是患者服用了抗生素类或者激素类等药品。若病人服药后，再一次同房，由此引起月经不调，应和干扰素关系不大。
这种是一种抗病毒药物，正常不会影响月经，所以可以安全使用。月经不调的原因可能是环境因素、气候变化、内分泌失调或心理因素。只要内分泌正常，心情不愉快，不要太累，有合理的工作和生活时间，月经正常。
乙肝的病毒携带者，如满足了干扰素的抗病毒治疗，应主动应用干扰素进行抗病毒治疗，但也有其不足之处，例如肝硬化失代偿期肝功能不好的患者，以及引起自身免疫有关的病症，例如甲状腺炎，自身免疫性的肝炎等。
干扰素的抗菌疗法有很大的优势，最大的优势就是可以停止使用。对于一些乙肝表面抗原呈阴性，但表面抗原含量偏低的患者，可以通过转阴来完成乙肝表面抗原的转阴，从而使乙肝病毒转阴，这个几率在30%以上，并且在转移后可以停止服用，周期比服用的护肝类的药物要快一些，大约需要一年的时间。
早期肝硬化的时候，可以用干扰素，但要看肝功的检查结果，如果有明显的肝功异常，是不宜用的，应该先做保肝治疗的，另外干扰素是抗病毒用的，主要是治疗乙肝，丙肝等病毒感染。
