如果两侧囊肿小，不用过分担心，定期去医院复查甲状腺彩超和甲状腺功能就可以了，有时还可以进行甲状腺核素扫描。一般3至6个月左右进行审查。
但是，在复查过程中，如果囊肿有明显的病变(如囊内出血或甲状腺功能有明显异常)，则应通过相关检查、囊肿切除、术后病理检查明确其性质。治疗过程中不能吃辣椒、辣条、麻辣火锅等过于辛辣的食物。最好不要喝含酒精的饮料。不要吃海鲜食品，如海带、贝类、水产品等。可以适当摄取水果、绿色蔬菜等富含维生素和纤维素的食物。适当摄入鱼、虾、瘦牛、羊肉等优质蛋白质，可以抑制囊肿的生长。
一般来说，甲状腺囊肿能治好。
甲状腺囊肿是指在甲状腺中发现含有液体的囊状物。一般情况下，甲状腺囊肿属于良性病变，通常能治好。如果囊肿肿大不影响到颈部外观，或者压迫其他的器官和喉返神经，观察即可；如果特别大，影响美观，或造成身体不适，可以进行囊肿摘除术。
患者在日常生活中应当加强身体锻炼，注意保暖，饮食清淡，不吃刺激性食物多，吃富含钙质的食物，不要吃刺激和油腻的食物。
甲状腺囊肿的危害主要与囊肿的大小有关，小的囊肿并不会造成危害，但是囊肿比较大的时候可能会引起颈部不适，甚至压迫气管和食道，出现吞咽困难、呼吸困难等症状，所以甲状腺囊肿的主要危害在于压迫症状，同时也有可能继发感染破裂或癌变。所以甲状腺囊肿的危害比较大，小囊肿定期检查不会有太大的问题，如果囊肿比较大，可以做甲状腺手术、硬化或者射频消融等治疗。
甲状腺囊肿属于良性疾病，当囊肿较小时，对人体的身体健康没有影响，一般不需要特殊治疗，定期进行甲状腺彩超，甲状腺功能检查等随访。如果囊肿持续增大，出现压迫症状，或者疑有癌变，应择期慎重考虑手术治疗，术后长期以甲状腺激素替代。
通常情况下，甲状腺囊肿可以进行体格检查、彩超检查、CT检查等。具体分析如下：
甲状腺囊肿是指在甲状腺中发现含有液体的囊状物，肿块呈圆形，直径多在2－5厘米之间，一般不疼或轻微疼痛，随着吞咽上下移动。多数是单发结节，少见于多发结节，可以进行体格检查、彩超检查、CT检查等，从而准确进行诊断。建议患者去医院检查，明确病因，然后对症进行治疗。
甲状腺囊肿形成的原因：
1、甲状腺腺瘤改变是由于瘤体缺血液化形成囊肿；
2、原发性囊肿是甲状腺腺体退化，多见于老年患者，属良性病变。如果不影响外观或压迫周围器官，就不需要做手术。甲状腺结节分为恶性结节和良性结节，恶性结节一般为实质性结节，边界不清、血流丰富、内部有钙化的囊性结节很可能为良性结节，内部无血流或钙化。