肛瘘不可以自愈，内口存在，脓肿虽然破溃或者已经切开引流，但是原发的感染灶，比如肛窦炎依然存在，肠腔内容物还可以继续从内口进入瘘管。肠腔中的粪便、肠液和气体继续进入瘘管刺激管壁，使得管壁的结缔组织增生，管腔难以闭合。脓腔引流不畅或者是外口变小，有时闭合，有时破溃，脓液积聚在脓腔内，导致脓肿再发，并破溃而形成新的瘘道。管道大多是在不同高度穿过肛门括约肌，肛门括约肌的收缩阻碍了脓液排出，导致引流不畅。
细菌感染，很多人由于没有养成良好的卫生习惯或者一些其他的原因，让细菌入侵肛管直肠部位，肛周脓肿，肛周脓肿是导致肛瘘的主要因素之一。肛门周围软组织感染红肿流脓，常不予以重视，没有及时治疗，结果脓肿破溃，脓液流出，腔壁形成结缔组织增生的坚硬管道壁，肛瘘由此形成。
主要是因为平时排便困难以及便秘等原因导致的肛门周围炎症以及血液循环不好引起来的一系列症状，调整饮食习惯，多吃蔬菜水果，多吃一些含粗纤维的蔬菜，可以达到通便的效果，排便困难不要太用力，多吃香蕉和蜂蜜水，有助于预防便秘。
是需要去医院进行手术的。而且这段时间需要养成定时排便的习惯，为了避免大便干燥，应多吃些新鲜蔬菜和水果，粗纤维的食物，辛辣刺激性的食物不能吃，需要戒烟戒酒，不要长时间坐着。
肛瘘的症状是反复脓性分泌物的排出，瘘管通畅无炎症常不感到疼痛，只感觉局部发胀不适，行走时加重，如外口封闭，瘘管积脓，则有疼痛，排便时加重。肛门周围皮肤受分泌物刺激常感觉瘙痒。
