脑干出血后遗症多会表现为颅神经异常，眼球活动异常，眼球内收障碍、外展障碍，瞳孔可能也会出现异常，如果影响三叉神经脊束核，患者会出现改面部感觉异常，如果影响到面、舌神经核，可以出现面瘫，主要是中枢性面瘫，还有舌瘫伸舌偏向一侧。如果影响了双侧锥体束，患者会出现肢体无力、偏瘫。如果双侧受累就会出现四肢瘫。总之脑干的后遗症的临床表现，主要根据受损部位的不同而表现不同。
脑干出血恢复步骤主要分三步：一、通过积极的保守和手术治疗，以挽救患者生命。二、待患者生命体征稳定之后，早期完善脑血管造影检查，明确引起脑干出血的病因。三、针对病因进行治疗，同时，早期介入康复治疗。
脑干的损伤，是否能苏醒、何时苏醒都是不能预测的。对于低血压患者饮食营养方面应给予高营养、易消化和富含维生素的饮食：适当补充维生素C、维生素B族和烟酰胺（维生素PP）等。
脑干出血患者的清醒时间主要取决于出血量的多少。如果出血量大约10ml，患者基本上没有清醒的可能性。因为在临床上脑干出血大于10ml，死亡率是接近100%。如果脑干出血量比较小，经过积极的保守治疗，比如脱水降颅压、清除氧自由基、护胃、营养神经等处理，一般在1周之内能够清醒。对于中等脑干出血的患者，早期经过积极的保守治疗，后期待病情稳定一般需要3周左右。
主要取决于脑干出血的量。如果脑干出血量比较大，有可能会在住院期间即发生死亡。对于脑干出血能够存活，如果出血量比较小，早期积极康复治疗，有可能得到完全康复。
