自身免疫性肝硬化的治疗，首先是针对原发病进行对症治疗，临床上可以选用激素给予控制原发病，还需要应用一些保肝药物对症治疗。此外，在饮食方面，注意不要让病人吃一些辛辣刺激的食物，不要吃对肝脏有影响的食物或者药物。可以适量吃一些肉类等蛋白质含量高的食物。
肝硬化腹水首先要控制钠、水、纠正低蛋白血症、适当利尿。肝硬化腹水也可通过微创治疗如TIPS支架，可以打通门静脉和体静脉，降低门静脉压力，但可能会导致肝性脑病得并发症。每个肝硬化患者的腹水情况都不一样，部分患者会出现严重的腹水，部分肝硬化患者在中早治疗的情况下，不会形成腹水。需要及早就医明确具体情况，配合医生进行治疗。
具有调节和增强人体细胞免疫功能的作用，能促使有丝分裂原激活后的外周血中的T淋巴细胞成熟，增加T细胞在各种抗原或致有丝分裂原激活后各种淋巴因子的分泌。治疗不好自身免疫性肝硬化。
肝硬化腹水的病人应该保持多种碳水化合物的摄入，不但能够提供机体足够的热量，还可以使得体内处分的糖原能够有效的防止肝细胞体内的毒素作用，能够有利于肝细胞的再生也可以减少蛋白质的消耗。
循环性自身抗体是诊断AIH的一个主要标准。90%的AIH病人血清中至少存在一种抗下列抗原的自身抗体：抗可溶性肝抗原/肝胰抗原(SLA/LP)、细胞核、平滑肌(SMA)、肝肾微粒体(LKM-1)、肝溶质抗原1型(LC-1)和粒细胞浆(ANCA)。在诊断AIH时，还应抗线粒体抗体(AMA)以排除原发性胆汁性肝硬化(PBC)。
自身免疫性肝炎是一种免疫性的疾病，自身免疫性肝炎只能得到有效的控制不能完全治好，但也不乏治好的可能性，主要是采取糖皮质激素或联合硫唑嘌呤的药物进行治疗，而对于终末期的肝炎，是需要采取肝移植的方式进行治疗。
