一般来说，碘伏和高锰酸钾因为其主要成份和作用都不一样，没有太大的区别。
碘伏的主要成份是活性碘，它是一种杀菌、杀菌的药剂，不刺激皮肤和粘膜，可以对皮肤、伤口、会阴处进行杀菌，因此它的应用范围很广，对病菌、霉菌、孢子等都有很好的杀菌效果。而高锰酸钾是一种很强的氧化剂，主要用于会阴、肛门等部位的消毒。
一般来讲治疗包皮龟头炎建议每天至少早晚两次泡洗,每次泡洗3-5分钟比较适合,如果时间允许,建议每天增加泡洗次数,比如说每天泡洗3-4次,能够更有效的去除包皮龟头炎。不能够浸泡时间过长，因为高锰酸钾溶液有一定的腐蚀性，时间长了以后会导致龟头皮肤损伤，引起化学性的炎症感染的表现，反而会加重病情的。平时少吃辛辣刺激的食物，忌烟酒，保持充足的睡眠，少熬夜。
通常来讲，高锰酸钾和碘伏相比较，碘伏会比较好。
如果高锰酸钾和碘伏做选择，那么碘伏的效果就会更好。因为碘伏是一种外科常用的消毒剂，具有很好的杀菌和消毒的作用，并且对伤口的局部刺激也是最小的，是一种比较温和的消毒剂。痔疮术后常用的是高锰酸钾溶液，平时可以用高锰酸钾溶液来清洗肛门，促进痔疮术后的愈合。因此，碘伏消毒水的作用更大。
一般情况下，高锰酸钾洗外阴好，但需再根据实际情况对应使用，具体内容如下：
高锰酸钾能清洗女性的阴部。真菌感染、细菌感染、自身荷尔蒙失调等都会导致女性出现外阴瘙痒，高锰酸钾具有杀菌、消炎的功效，能彻底治疗真菌性瘙痒，能有效地控制细菌所致的瘙痒，但对于其它的病症或者是自身的内分泌失调所致的瘙痒，并没有太大的作用。高锰酸钾是一种很强烈的刺激物质，女性的阴部肌肤是非常脆弱的，如果经常使用高锰酸钾，很可能会对肌肤造成伤害。
高锰酸钾浸泡伤口15-30钟，可以用高锰酸钾泡伤口，可以用来治疗肛裂、内痔、混合痔、肛裂等。高锰酸钾是一种化学药物，具有消炎止血的功效，它的作用是杀死细菌，并能让伤口收敛。目前，对于内痔和混合痔，在Ⅲ度以下的痔疮，一般都是以保守为主，不能彻底根治。
一般情况下，1:5000的高锰酸钾坐浴15-30钟，新鲜肛裂，即急性肛裂患者，可以选择1:5000的高锰酸钾，坐浴15-30钟。因此，高锰酸钾浸泡伤口15-30钟，一天1-2次，并且视效果而定。
