治疗要明确是那种疾病再进行治疗，可以到正规医院内分泌科或外科就诊检查，根据病情采取激素类药物、手术、放疗等方法治疗。甲状腺-肾上腺皮质激素、性激素替代疗法，适用于全垂体功能衰退引起的多腺体功能减退者。垂体性闭经-手术和放射疗法垂体性闭经-食疗。
脑垂体功能下降导致的闭经，可能是由于腺垂体激素分泌减少，引起卵巢激素分泌不足，所以导致垂体性闭经。可以补充外源性的激素进行治疗，或者用中医中药进行调理。中医多认为是由于肾精不足导致的，可以用补肾固精的中药治疗。
脑垂体功能下降导致的闭经，可能是由于腺垂体激素分泌减少，引起卵巢激素分泌不足，导致垂体性闭经。可以补充外源性的激素进行治疗，或者用中医中药进行调理。中医多认为是由于肾精不足导致的，可以用补肾固精的中药治疗。
垂体肿瘤治疗是抑制肿瘤的自发激素分泌，切除肿瘤，保持异常的垂体功能，减少肿瘤对视力的影响，防止肿瘤的复发。垂体肿瘤有三种主要治疗方法：药物治疗、外科治疗和放疗。
下丘脑垂体闭经就是指下丘脑分泌的促性腺激素释放激素减少，导致垂体分泌的促性腺激素减少，再作用于靶器官子宫及附件，出现闭经的症状。下丘脑垂体闭经应进一步查明病因，以便针对病因治疗。
脑垂体闭经不可以促排，闭经可能由疾病引发，也可能由生殖器官不健全引发，总之引发闭经的原因比较多，闭经是会导致女性不排卵，从而引发不孕症，所以对闭经的情况必须要及时的治疗。
