呼吸暂停综合征的治疗包括一般治疗、手术治疗
1、一般治疗：对因肥胖导致的患者，可进行减重治疗；而对因体位导致的，可改变卧姿以侧卧位睡姿来减少上气道阻塞情况。
2、手术治疗：适用于如鼻腔阻塞、咽腔狭小、悬雍垂肥大、扁桃体肥大等原因所致的患者，可以医生指导下通过采取鼻中隔或鼻腔手术、腭咽或咽腔手术、下颌骨前徙术等手术方式来进行治疗。
睡眠时呼吸暂停是可以治好的，如果是高血压引起的睡眠呼吸暂停，服用降压药后积极控制血压，腺样体肥大导致的睡眠呼吸暂停可以通过手术切除的方式来消除呼吸道阻塞。
诊断睡眠呼吸暂停可根据患者家属描述，根据病人打呼噜时出现呼吸停顿，由医生采用睡眠呼吸监测仪来进行佩戴过夜，测定是否出现呼吸暂停、呼吸暂停次数、暂停时间以及呼吸暂停种类来诊断。呼吸暂停分为阻塞性、中枢性和混合性睡眠呼吸暂停。通过睡眠呼吸监测可甄别出呼吸暂停类型，判断轻度、中度和重度，采用相应的方法进行治疗。
呼吸睡眠暂停综合征是一种由于呼吸中枢传导、呼吸信号出问题或者外周肌肉呼吸受到阻塞引起的呼吸暂停，尤其是在睡眠过程中反复出现缺氧，大脑和心脏反复缺氧从而继发一过性的脑梗塞、脑缺血以及高血压、冠心病的症状，叫做呼吸睡眠暂停综合征。
主要强调综合治疗为主，比如戒烟、戒酒，肥胖者要减轻体重，手术治疗针对于扁桃体腺样体肥大者，进行扁桃体、腺样体切除术。针对于鼻中隔偏曲、鼻息肉或者是鼻甲肥大者，可以进行鼻中隔成形术，鼻息肉或者鼻甲切除，以减轻症状。
如果是偶尔的一次睡眠呼吸暂停不会对人体健康造成什么危害，但是如果这种窒息长期反复发生，病情严重者可出现心肺功能衰竭，甚至猝死，所以一旦频发发作一定高度重视，查明发病原因是关键。