进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
全身的检查和常用的辅助检查，如腹部彩超，心电图，胸片等。具体的男科检查包括实验室检查如尿常规，前列腺液常规，血常规，分泌物检查，内分泌系统血液指标检查。男科超声，如前列腺，精囊，阴囊等超声检查，尿流率测定等。
一般情况下，所谓全面妇科检查指子宫附件彩超、宫颈TCT、HPV筛查、支原体和衣原体感染、白带常规等，费用约为600~800元。其中，子宫附件彩超检查主要是对子宫附件是否有器质性疾病进行检测，而宫颈TCT和宫颈癌的初筛检查都是针对宫颈癌患者进行；HPV检测可用于早期诊断子宫炎等妇科疾病；支原体、衣原体感染的检查则属指导分泌物特殊病原菌。
首先是尿糖测定，其次是血糖测定，目前多采用葡萄糖氧化酶法，还有葡萄糖耐量试验，葡萄糖耐量试验包括口服葡萄糖耐量试验，静脉葡萄糖耐量试验。可的松葡萄糖耐量试验，胰岛素测定，C肽测定。
通过妇科的专科检查即内诊可以检查子宫的大小，位置，活动度，是否有肌瘤，是否妊娠等。通过彩超也可以检查子宫，可以显示子宫是否有占位，宫腔内是否有妊娠组织的残留，葡萄胎，子宫内膜的厚度及回声，宫腔内节育器的情况，子宫是否有畸形等。
全面的体检要检查血压、心率，身高、体重等，内科项目有心、肺的听诊、肝、脾及腹部的触诊，外科检查有皮肤，脊柱、四肢等等，五官科检查有视力，听力，口腔及咽喉和鼻等的检查，化验项目有血、尿、粪的常规检查，肝功能，乙肝两对半，血糖，血脂、肾功能等的检查，放射做胸片等的检查B超做肝、胆、脾、胰及双肾和输尿管等项目。
