乙脑疫苗比较安全，仅有少数小儿会出现不良反应。注射乙脑疫苗后可出现发热，还可出现头痛、头晕、乏力、寒战等全身症状，也可出现腹痛、腹泻、呕吐等胃肠道症状，一般在1天内可自然消退。注射乙肝疫苗后还可出现局部不良反应，如注射部位发红、肿胀、出现疼痛、皮温升高等，局部的不良反应一般持续数个小时。
孩子打完乙脑疫苗后发烧一般不会超过三天,乙脑疫苗作为外源性的致热源,可以引起机体发热,这种发热一般大部分孩子都是低热,很少有高热的,持续时间不超过三天,大部分孩子在一天左右。另外，乙脑疫苗接种后的不良反应还包括注射局部红肿、疼痛以及食欲不振、胃肠不适等消化道症状，一般持续3天左右就会自动消失。在生活当中也应当注意，不要过度的情绪激动，不要吃热性的食物，多吃蔬菜水果。
在打了疫苗后，容易出现感冒的症状出现鼻塞，流鼻涕，发烧，如果是症状轻的，不用担心要及时治疗，如果症状严重，需要到医院做检查，看看是不是细菌感染，如果有炎症，需要服用消炎药物的。
宝宝注射乙脑疫苗以后，大部分会出现低烧，如果体温在38度左右，可以用温水擦浴的办法进行降温。如果体温较高超过38.5度以上，就需要考虑服药退烧，发烧期间还需要观察孩子是否有咽喉红肿，口干舌燥等。
是慢慢会被吸收的，但是必须要注射的，因为是肌肉注射，很快就会被机体吸收，所以会很快地进入血液循环，24小时内不要洗澡，以免针眼儿处接触水之后感染，造成疼痛、红肿等症状。
乙脑疫苗通常需要注射三次左右，因为注射三次左右才会产生抗体才会有免疫力，这样才可以有效的预防宝宝发生疾病。有些打完疫苗后没有产生很好的抗体还需要在注射一次，一定要按时给宝宝进行注射疫苗，打疫苗的时候也要在宝宝没有生病的情况下进行注射。
