新生儿的消化道畸形主要是先天性肠狭窄和先天性肠闭锁，这种情况一般都是通过外科手术来治疗的。
外科治疗的原则就是要清除狭窄，按照狭窄的类型，可以分为肠腔狭窄和膜状狭窄，有些是因为肠外肿瘤压迫造成的。如有肝外压迫，应先排除压迫。如果有肠管狭窄，需要先切除肠管，再进行肠腔吻合。
建议在治疗期间多给新生儿补充营养，尽量母乳喂养。
一般情况下，先天性幽门狭窄，患者可以通过手术治疗的方式进行改善，具体情况分析如下：
先天性肥大性幽门狭窄是一种器质性疾病，是一种不能用其他方法来治疗的器质性疾病，早期采用开腹手术，现在采用腹腔镜切除孩子的环状肌肉，对孩子的影响不大。此外，还可以通过儿童胃镜进入胃腔，在不损害儿童幽门周边粘膜的情况下，利用粘膜下隧道切开幽门肥厚环形肌。
一般来说，先天性髋关节脱位称为发育性髋脱位。发育性髋脱位怎么办，需要根据实际情况进行判断。
如果患儿年龄较大，髋脱位已经固定，尽管进行手术，也可能会留下不同程度残疾；如果是6个月之内新生儿出现发育性髋脱位，可以在医生的指导下通过使用支具曲髋屈膝固定的方式进行治疗。如果是6-18个月婴儿出现发育性髋脱位，通常可以在医生的指导下通过切开复位，石膏固定等方式。如果是3岁以内的幼儿出现发育性髋脱位，则可以在医生的指导下通过股骨截骨手术进行治疗。
一般情况下，儿童先天性免疫缺陷病可通过日常护理、胸腺移植等方法进行改善，具体内容如下：
小儿先天免疫缺陷症要在日常的日常生活中要多关注宝宝的生活，避免接触污物，保持良好的家庭卫生，避免引起传染。可以通过服用补药来改善机体功能，增加免疫力。骨髓移植能使某些患儿的免疫功能得到恢复，例如：重度联合免疫缺损，共济性毛细血管扩张。至于Nezelof综合症，可以通过胚胎胸腺移植进行再生。
先天性弱视是一种常见的疾病，目前还没有明确的病因，比如先天性弱视，比如屈光不正的矫正和弱视训练，但是先天性弱视的发病率比较高，一般都是先天性弱视，这种疾病的病因还不明确。
一般认为是因为新生儿的视力发育不良，比如视网膜或视路出血，引起的视力发育异常。小孩先天性弱视一般没有较好的治疗方法，只能通过采取一定的治疗缓解不适，避免对日常生活造成太大影响。
