肛瘘手术大多采用的都是拔线手术，手术后要定期的绷紧线。然后尽现真的特别的疼，如果疼痛难忍可以吃止疼药。手术以后要勤换药，注意观察伤口，要保持大便通畅，定时排便，保持肛周清洁卫生，勤换内裤，增加体育锻炼，避免久坐久站，可以做一些提肛运动。
肛瘘常有肛周脓肿自行溃破或切开排脓的病史，此后伤口经久不愈，成为肛瘘外口，主要症状是反复自外口流出少量脓液，污染内裤，有时脓液刺激肛周皮肤，有瘙痒感，若外口暂时封闭，脓液积存，局部呈红肿，则有胀痛，封闭的外口可再穿破，或在附近穿破形成另一新外口，如此反复发作，可形成多个外口，相互沟通，如瘘管引流通畅，则局部无疼痛，仅有轻微发胀不适。
使用广谱的抗生素进行抗炎治疗。局部进行温水坐浴，也可以用药物坐浴，然后配合局部的理疗。肛瘘伴急性感染出现的疼痛，没有特殊有效的办法，可以适当吃止痛的药物。
可能有先天发育的关系，不会很痛。应该到正规医院肛肠科检查一下。可以局部消炎等保守治疗。必要时手术治疗。平时生活中注意护理，多给孩子喝水，多晒太阳，多吃新鲜的水果蔬菜汁。合喂养，如果吃母乳，要调理大人饮食，如果奶粉喂养，注意奶粉冲泡浓度。
肛瘘疼痛比较明显，可以口服止疼片，比如曲马多药片，可以有效的缓解疼痛。如果疼痛的特别严重，也可以静脉滴注福比洛芬来止疼，这样止疼效果会比较长。疼痛比较明显的时候也可以肛塞，具有解热镇痛的作用。
