植物神经功能紊乱的治疗主要是在心理方面进行疏导，去除植物神经功能紊乱的诱发因素，还有使用调节植物神的药物来进行治疗。如果患者还有焦虑、抑郁的情绪可以使用抗焦虑、抗抑郁的药物进行对症的治疗。
心脏植物神经功能紊乱是以心血管疾病的有关症状为主要表现的临床综合征，属于功能性神经症的一种类型。大多发生在中、青年，20～50岁较多见；女性多于男性，尤多见于更年期妇女。治疗主要是要注意改善情绪，避免紧张、激动、生气等消极的情绪，乐观开朗是治疗植物神经功能紊乱的关键。适当对症药物治疗。
植物神经功能检查方法：卧立试验：平卧位计数1分钟脉搏，然后起立后再计1分钟脉搏。由卧位到立位脉搏增加10次-20次为交感神经兴奋性增强。由卧位到立位若减少10次-20次为副交感神经兴奋性增强。对植物神经系统的检查，主要是为了协助临床诊断，很少只进行这方面的单独检查，因为独立的植物神经系统疾病很少。
植物神经紊乱是非脏器的器质性病变，多女性患病，可出现多系统综合自觉症状，如头痛头晕，失眠多梦，急躁易怒，出汗心慌，情绪不稳定，也会出现胸闷气短，腹胀，食欲不振等。只是失眠头痛不像是植物神经紊乱，可能是近期精神紧张，思想压力大或过度劳累所致，注意休息观察或到医院就医查诊。
可以使用一些维生素来改善一下，生活中注意休息避免劳累，学会自我调节放松心情，可以给予安神镇静及营养神经药物，调整好情绪，避免压力过大的，平时注意生活规律的。避免过度劳累，多注意休息，有利于改善。
不是更年期综合征，更年期综合征是指女性在45岁到55岁之间，由于身体内雌激素水平低落而导致的绝经，失眠，潮热，盗汗，心悸一系列症状，失眠，潮热，心悸等是植物神经功能紊乱的表现。
