一般情况下，先天性颈椎齿状突畸形可以通过日常护理、使用药物等方式进行处理，具体内容如下：
如果患有先天性颈椎齿状突畸形，出现颈椎痛症状，可以口服一些非甾体抗炎药物，如先天性颈椎齿状突畸形等。如果先天性颈椎齿状突畸形病情比较严重，患者可以通过手术进行治疗，有较好的治疗效果，患者需注意，在术后应多注意休息，还应保持营养均衡的食物，有利于身体恢复。
先天性并指多指畸形的治疗方法有如下几种：
一、手术
如果患者无法站立或行走异常，则可以通过手术来进行治疗。
1、表皮：采用“Z”形的方法，将剩余的手指（趾）组织起来，用来覆盖分开的并指，当骨头并连的时候，将其连接起来，并连在一起，一边被肌腱下的皮的时候，再进行侧副韧带的修复。
2、平衡肌力：严重并指多指，由于有内部肌指头的异常，所以要进行肌腱止点再造。
3、调整骨力线：指骨力线不正常时应进行截骨，某些重度多指并指畸形中有三节拇、纵向括弧骨等结构，应进行截骨，以纠正力线。
二、其他治疗
手术后疤痕疙瘩应及早介入治疗，疤痕疙瘩是由于术后皮肤受损，导致的胶原蛋白过多而导致的一种真、原形态，呈现肿块状浸润，在医学上称为“良性真皮瘤”。
1、瘢痕注入：采用5-氟尿嘧啶及类固醇等在瘢痕部位进行局部注射。结，应用低浓度的甲基喋呤配合叶酸能明显地阻止疤痕组织的增殖，如果有明显的疤痕增殖迹象，应尽早进行治疗。
2、光电治疗：主要是激光和其它治疗方法，强脉冲激光和595nm脉冲色素激光具有吸收血红蛋能降低疤痕的供血和去红的效果，适合于肥胖的增生性疤痕或者疤痕疙瘩。
3、光纤治疗：将纤维引入疤痕的内侧，可通过光热法的直接效应，达到促进疤痕愈合的目的。
4、压力治疗：压力治疗应该在手术后尽早进行，给予手指上的压力可以减轻脚跟外侧旋转。
先天性脊柱畸形可以通过坐姿、佩戴矫形支具、外科矫形改善，建议患者积极治疗，具体分析如下：
先天性脊柱畸形有两种类型，一种是姿势性的，另一种是结构性的。坐姿、佩戴矫形支具、定期复查可以改善姿势性先天性脊柱畸形，如果在这个过程中畸形加重或矫形不满意，可以进行外科矫形。结构性先天性脊柱畸形指的是先天性椎体发育不良，比如楔形椎、半椎体，或者是未知的脊柱畸形，不能用支架来矫正，需通过手术治疗。
病人年龄较大，完全适应畸形手的生活习惯，尺骨严重弯曲，血管及神经短缩病变也越来越重，即使行手术矫正，病人难以接受，且易发生严重并发症。先天性桡骨缺失的范围从简单的桡骨发育不良到完全的桡骨缺失。这种畸形可以是孤立的缺失，但更常见的是，在某种程度上，同时存在几种畸形。
通常情况下，先天性的小脑畸形可以通过手术来治疗。
小脑扁桃体下疝畸形是先天性的，只有手术才能治疗。没有明显的临床表现或只有轻度头痛的病人，通常不需要进行任何的治疗。如果出现了明显的共济失调，比如走路不稳，或者是由于压迫、粘连所致的脑干、颅内神经损伤，就需要进行外科手术。手术方式以头后窝和颈髓减压为主，多数病人在术后症状有明显好转。
先天性多指畸形需要采取物理治疗和手术治疗。
对于先天多指畸形的儿童，在六个月之前，要注意对主指和多指相邻的手指进行适当的牵引和按摩，以确保主指的正常发育，如果超过了六个月，可以做多指切除手术，也可以做主指的整形手术。儿童在六个月后，手指的神经、血管、肌腱、结构比较清楚，可以采用多指切除，多指与主指各切除一部分，将两根手指合为一根手指。