软腭裂手术的成功率是百分之八十，新生儿的组织单薄，机体抵抗力低，经不起手术打击，所以不主张此时手术。最好的时机是6-9个月，此时有一定抵抗力，门齿已萌出，及时手术还可避免上门齿外突畸形。事实证明术后恢复也快。腭裂手术时间要再晚些，为病儿口腔太小时手术进行困难，但最好不得迟于5岁。
唇腭裂与腭裂是不相同的，唇腭裂包括唇裂和腭裂，而腭裂就是单纯的腭裂。唇腭裂比较严重一些，原因不明确，可能与怀孕期间内分泌紊乱，病毒感染等有一定关系。早发现在治疗。
对于唇腭裂患者的最佳手术时间，原则上是越早治疗越好。唇裂手术在患者机体免疫力健全的情况下，最早可在出生后24小时内手术，也可在出生3个月后，因为这时不仅婴儿的免疫力较强，可以耐受感染，而且这时机体的组织细胞也都很幼稚，不易形成瘢痕，为术后畸形恢复，创造良好的条件。而腭裂手术最早也要在婴儿出生后6个月以后进行。
唇腭裂是一种常见的先天性畸形，属于染色体隐性多基因遗传病，唇腭裂不仅与遗传有关，受环境的影响也很大，如在妊娠期最初的三个月，缺乏营养，或者孕妇精神紧张，或感染了病毒，口服药物，内分泌的影响等，都有可能造成唇腭裂的发生，所以在孕期也要避免接触可能导致胎儿畸形的有害物质。
腭裂手术后有可能会说话正常。如果腭裂手术前软腭肌肉比较厚，做完手术以后语言功能会大致恢复到正常。如果腭裂手术前软腭的肌肉不发达，比较薄，手术以后语音功能恢复也比较差。
