一般来讲，阴茎根部长痘痘的原因有很多，具体原因如下：
1、阴茎根部脂肪瘤。脂肪瘤是一种良性的肿瘤，其特点是皮肤下有平滑的结节，没有明显的临床症状，一般都是通过外科手术来去除。
2、阴茎根部的毛囊炎。毛囊炎是一种由毛囊引起的细菌感染引起的，其症状是局部的包块，并伴有红肿、疼痛。可以在医生指导下服用一些头孢类的药物，可以在医生指导下外用百多邦软膏。
3、皮脂腺囊肿。如果是由于皮脂腺管的开口阻塞，也要做外科手术。
不排除有阴茎炎存在。包皮过长，局部卫生不清洁，手淫，外伤感染，不洁性交等都可引起该病。疾病是不断发展变化的。到医院生殖感染科做检查后给予对症处理。如果不进行及时治疗，病菌和炎性分泌物容易藏匿与包皮里直接作用于病变部位，加剧病情。
阴茎根部长了痘痘很疼，常见的是毛囊炎，它是红色的丘疹，表面可能会有脓疱，然后按压会有明显的疼痛，治也有可能是尖锐湿疣，是性病的一种，是人乳头瘤病毒感染之后导致的。表现是菜花样的或者是鸡冠样的赘生物，比较硬，容易出血，治疗的情况下可以选择激光，然后局部外涂抗病毒的药膏。也不能除外皮肤肿物，疥疮结节等，需要医生面诊确定。
问题分析：初步考虑为鲍温样丘疹病。需要进一步明确诊断，配合辅检。
指导建议：手术活检，配合创面清洁护理，外敷生长因子凝胶。
阴茎根部长有阴毛的部位长出了肉疙瘩，可根据具体情况对症处理：
1.不排除是毛囊发炎，可以使用红霉素软膏，保持局部清洁和干燥，不需要进行任何治疗，毛囊导致的肉疙瘩会逐渐消失。
2.如果是病毒疣，可以通过激光点除和更昔洛韦软膏来治疗。
3.如果有过不洁的性生活史，要考虑是不是尖锐湿疣。经相关检查确诊后，要进行激光点除，同时还要进行全身抗病毒药物的治疗。
建议患者及时就诊，根据个人症状轻重进行相应治疗。
放松心情，有可能是上火引起的粉刺什么的，也有可能是病毒引起的尖锐湿疣，皮肤表皮感染比如毛囊炎皮下皮脂腺分泌旺盛堵塞都会导致皮下感染。毛囊炎导致化脓的可能性大，注意个人卫生，禁辛辣，刺激性食物，穿宽松内裤，定期做常规体检。
