瘘管的治疗方法有手术治疗、保守治疗和姑息治疗三种。手术治疗主要是做瘘管切除，如肛肠科的肛瘘，都采用手术治疗，可以做瘘管切除，也可以做瘘管挂线等手术方法。腹部的一些肠漏形成瘘管了，也需要手术修补。有些瘘管可以采取介入硬化的方式进行保守治疗，也可以收到很好的效果。少数瘘管为恶性病变，如果到晚期，就只能采取姑息治疗。
瘘管的治疗方法有传统拔线疗法和手术瘘管切除法没有其他治疗方法，肛裂药物治疗无效，肛瘘的特点是肛门外有一个或多个瘘口，长期分泌粘液，沿瘘口向肛门方向，可触及瘘口。
先天性耳前瘘管跟遗传有很大的关系，先天性耳前瘘管可以分为单纯性，感染性和分泌性的，单纯性的属于最轻的，也是较好治疗的，如果是没有什么症状，可以不需要药物治疗，平常观察就可以，感染性的就需要治疗了，如果是出现局部瘙痒，而且伴有脓液流出者，建议可以选择手术治疗的方式，手术治疗是较好的方法，也是最有效的方法。
如耳前瘘管无感染，则无需治疗，注意局部清洁卫生即可。先天性耳前瘘管是胚胎发育期第一腮沟封闭不全所致，为常染色体显性遗传病。在炎症静止期，可做手术摘除瘘管，术中需要仔细寻找分支摘除，以免残留复发。
可以通过以下方法治疗非哺乳期乳晕部瘘管：
患者如果病症较轻，可以通过抗生素药物治疗得到改善，比如头孢氨苄等药物进行治疗。如果病症较为严重，需要及时到医院进行详细的检查，明确病因后进行针对治疗，有必要时还需要进行手术治疗。
平时要保持心情的舒畅，避免生闷气，避免情绪过于暴躁。多吃些富含维生素的水果和蔬菜，对疾病恢复有一定好处。
小儿分泌性中耳炎是一种自限性的疾病，通常先不用药物治疗，长期用抗生素治疗效果不好，副作用较多。
除了个别病例，不建议长期用激素治疗。分泌性中耳炎是自限性疾病，有治愈的可能，进行微创治疗前要密切观察3个月，3个月内多数小孩都会自愈。若疾病持续了4个月以上，有听力减退或其他症状，分泌性中耳炎持续或经常复发，要根据专业的耳鼻喉科医生诊断，决定是否要手术。
