无痛肠镜检查一般是不痛苦的。具体情况分析如下：
无痛肠镜主要是用丙泊酚做全身麻醉的，病人在麻醉后是没有意识的，但是在做结肠镜的时候，需要注入适当的气体，观察肠腔的情况，为了观察病变，可能会反复的进镜观察，有时会导致肠腔内有大量气体，醒来后会出现肚子绞痛，顺时针揉肚子排出气体就可以了。总体来说，无痛肠镜是一个不错的选择。
通常来说，普通肠镜检查会有一定的痛苦感。
肠镜是一支细长可弯曲的医学仪器，直径大约1厘米，结肠镜通过肛门进入直肠，直到大肠，可让医生观察到结肠和大肠的内部情况。结肠镜检查是医生用来检查大肠及结肠内部病变的一种诊断方式。而普通肠镜检查一般不会进行全麻，所以会有一定的痛苦感。建议术前做好清洁工作，以免加重不适的症状。
通常情况下，患者做十二指肠镜检查，不会痛苦。具体情况分析如下：
十二指肠镜检查是一种利用纤维内镜检查十二指肠疾病的方法，常用于诊断胰胆管开口处的病变,如结石、狭窄、肿瘤等，目前患者可以通过静脉复合麻醉注射丙泊酚等，让患者检查时无任何不适，因此患者做十二指肠镜检查，不会痛苦。
患者配合治疗的同时，还应注意休养，避免劳累，注意保暖，多喝热水，多食用清淡的高蛋白食物，以促进身体的恢复。
肛肠镜检查没有严重的痛苦，部分人会感觉轻微不适。痛苦的程度决定因素如下：肛周本身的疾病种类。如果是肛裂或者肛周脓肿，则痛苦较重一些，如果是单纯的痔疮，没有嵌顿则痛苦轻一些。病人本身的敏感程度，敏感程度越高，痛苦越明显。操作的轻柔程度。操作的手法越轻柔，痛苦就会越小。设备的先进程度。操作的设备越先进越符合人体的生理情况，则痛苦越轻。
普通肠镜检查肠子比较直的不太痛，肠子弯的过弯的时候特别疼，是那种无法忍受的痛，不过时间很短，撑过去就没事了，注意一定要放松，不要因为紧张绷得太紧，那样肠镜很难通过。
