不一定的，如果孕妇在怀孕的时候有急性或者慢性疾病，可能会对胚胎造成不良影响。或者在过程中又接触到一些有毒有害的物质，体内存在叶酸缺乏等，就可能会导致流产、胎儿畸形等问题。
意外怀孕也可以保留胎儿，并不代表孩子发育异常，可以继续妊娠。但是需要多休息，不要劳累，不吃辛辣刺激食物，禁止性生活，防止细菌病毒感染，口服叶酸预防胎儿神经管畸形，去医院做B超和六项激素检查，观察是否正常。
流产的方法非常多，有药物流产和人工流产。药物流产适用于怀孕7周之前的流产，流产的方法是口服米非司酮，联合口服米索前列醇用药。米非司酮服用2天，米索前列醇在第3天服用，一般在服用米索前列醇之后6个小时之内，就会有胚胎组织排出。人工流产就是做手术进行刮宫，手术又分为无痛人工流产和普通的人工流产。
意外怀孕一般在四十天到五十天之内可以流产。
自身流产须B超证实为宫内孕，那么血hcg、尿hcg就说明妊娠时，才能做流产。所以说对于孕妇来说，最好选择在医院里做一次人流或者药流来终止妊娠。无论药流，还是人工流产，通常40天至50天内，进行那项手术更好。一般都是选择药物治疗或者人流手术。由于此时孕囊直径亦不大，那么此时手术及药流造成的伤害一是小一点，那么出血就少一点，过小，则操作不方便，那么药流有时不易排出。另外一个就是时间太长，可能会有流血过多，还有可能出现贫血等现象。过大会使子宫内膜受损，那么流血就会更多。
造成意外怀孕的原因如下：
首先是没有采用避孕措施，很多女性没打算要孩子，然而在性交前却没意识到要采用避孕措施，或者是有些女性认为在安全期性行为是绝对安全的，因此不采取避孕措施。其次是采取的避孕措施不安全，如体外射精，安全期避孕等。都还是有可能会导致怀孕的。如果感觉到避孕失败，可以服用紧急避孕药来补救。
如果意外怀孕前没吃叶酸，孕后要连续吃3个月，可以很好地预防胎儿畸形，不妨买一些孕妇专用的叶酸片，孕前没有补充孕后也不可大量服用，吃多了会阻碍身体对锌元素的吸收。
