手术方法取决于病因的性质，例如先天性肾盂输尿管连接部狭窄可作肾盂成型术，肾、输尿管结石可行碎石或取石术，这些手术近年可用内腔镜进行。术后肾积水及肾功能会有所改善。
肾积水较轻，病情进展缓慢，肾功能已达平衡和稳定状态可观察，但应定期检查了解积水进展情况。可自行解除的梗阻，如孕妇生理性肾积水。肾积水进行性加重，临床症状明显，肾功能不断下降，梗阻病因明确，有并发症存在，应手术治疗。
一般情况下，小儿肾积水可以采取以下办法做手术。具体分析如下：
儿童肾积水的外科治疗一般采用的是腹腔镜，采用三孔技术，在左右两边开一个洞。一般都是通过肠系膜，或是通过肠系膜外的方法，将肾盂与肾盏之间的狭长部分取出，然后将其取出，将其切开，然后将其缝合起来。手术结束，放置J型导管，放置腹腔内导管。如果没有大量的腹水，术后第二天或第三天就会取出，放置于输尿管内的导管，术后4至8个星期即可取出。
肾积水这个疾病是需要手术的。需要通过手术治疗来解决梗阻的病因，从而疏通泌尿系统，也可以通过其他的方法也能够解决，比如结石不大的时候可以听通过体外超声波碎石。不管如何治疗都必须定期去医院复查。
一般手术费用在9000元到11000元之间。肾积水是由于患者的泌尿系统的梗阻导致的肾盂与肾盏扩张，其中潴留尿液，则被称之为肾积水。针对于肾积水的治疗，所处的不同地区，做肾积水手术所产生的费用也不一样。对于肾积水症的手术费用，应该要根据肾积水患者发生的肾脏健康程度、积水面积，是否存在并发症等，来进行综合评估。
在小儿泌尿外科，肾积水手术是一个常见的手术，无论是我们做开放手术，还是腹腔镜手术，常见的是腹腔镜手术，放一个可视镜，就是我们的眼睛看的是目镜，腹腔镜下做手术，在其上下两侧各打一个孔，三孔法来做腹腔镜手术，术后放双J管，放腹腔引流管，如果腹腔引流不多，术后第二天、第三天就拔了，整个过程就是这样的，术后就随访三个月、半年、一年长期随访。
