手术伤口不愈合，最常见的就是感染所导致的，所以应该仔细的处理伤口，去除分泌物或者感染原，也有一些病人是继发的异物，尤其是外伤之后导致异物残留，应该将异物清除，并且在术后也需要积极的抗感染治疗。
伤口愈合分为三个阶段，第一阶段是急性的炎症期，在手术之后伤口内部会有少量的渗血、渗出，并且有炎细胞的聚集，表现为伤口有局部的红肿。第二阶段是细胞增生期，主要是成纤维母细胞和新鲜的肉芽组织的形成，从伤口底部开始生长，将伤口填平，促进伤口的愈合。第三阶段是疤痕形成期，成纤维的母细胞以及肉芽组织会逐步的形成疤痕组织，将伤口填平，也就是伤口会愈合，疤痕组织会有一定的抗张力，防止伤口进一步的出现裂开等情况。
大多数是需要一到两个月的左右的时间。状况不宜生长过快，做好消毒及消炎治疗，以免假性愈合从而再次形成肛瘘，恢复期间需要注意辛辣刺激的，注意休息，保持好良好的心情。
手术以后主要就是加强营养，这样身体才会好得快，长伤口就是了；辛辣刺激的饮食不要吃。需要注意服用一些富含蛋白质的鲫鱼汤以及黑鱼汤来促进伤口愈合治疗为宜增加身体营养，避免服用生冷食物为宜，积极治疗。
手术前后饮食调理得当，不仅能保证手术顺利进行，而且对创面的修复起到重要作用，还能减轻疼痛，有利于伤口愈合，同时可防止和减少术后并发症的发生。还要适当补充营养，多吃一些富含蛋白质、维生素的食品，如新鲜水果蔬菜、瘦肉、鲜鱼、蛋类、奶或豆制品等。注意个人卫生：要注意保持个人卫生，否则易造成感染。
手术以后，伤口愈合分为三个阶段，第一阶段是急性的炎症期，在手术之后伤口内部会有少量的渗血、渗出，并且有炎细胞的聚集，表现为伤口有局部的红肿。第二阶段是细胞增生期，主要是成纤维母细胞和新鲜的肉芽组织的形成，从伤口底部开始生长，将伤口填平，促进伤口的愈合。第三阶段是疤痕形成期，成纤维的母细胞以及肉芽组织会逐步的形成疤痕组织，将伤口填平，也就是伤口会愈合。
