要先进行止咳的治疗，往往可以缓解肚子肌肉疼的现象。首先要明确咳嗽的病因，如果是发生呼吸系统感染引起的咳嗽，往往会伴随鼻塞、流鼻涕、嗓子疼、咳痰、咽干、声音嘶哑的现象，需要使用消炎类的药物进行治疗。
咳嗽出现肚子疼的症状，大多是由于咳嗽过度频繁引起腹压增加所致。咳嗽的时候膈肌下降，会引起腹压增加，可能会出现恶心呕吐、腹痛的症状。特别是频繁剧烈的咳嗽，症状比较明显。治疗上还是以抗感染，缓解呼吸道炎症为主。可以用抗生素，配合化痰止咳的药物治疗，缓解咳嗽的症状。
小儿重感冒咳嗽时，腹泻的症状应为胃肠感冒，应服用润肺止咳化痰的药物，然后用止泻药物治疗腹泻。有些药物应该口服，以帮助消化和调理脾胃。在此期间，应尽可能注意清淡饮食，不要吃太油腻和难消化的食物。普通感冒的治疗主要基于症状支持。服药时应尽可能选择儿童专用药物。
气逆不降，病涉多脏，有虚实之别。气之升降从脏腑功能看，以肺胃肝功能影响明显。肺气逆肺气既主宣发，又主肃降，而以宣肃下行为顺，邪气内扰，则肺气不能宣发或肺脏本虚，肃降无力，以致咳嗽、喘促、胸闷气急。胃气上逆胃主受纳腐熟，其气以息息下行为顺，以降为和。外邪犯胃，或饮食所伤。
咳嗽肚子右边疼痛很有可能是咳嗽牵拉腹部肌肉的疼痛，此时进行治疗咳嗽效果就比较好。需要检查血常规和C反应蛋白，如果出现单纯的C反应蛋白增高，往往是病毒性感染引起的咳嗽，可以使用消炎口服液进行治疗。如果出现血常规中白细胞升高，说明是细菌性感染引起的咳嗽，需要使用抗生素进行治疗。
咳嗽时肚子疼，考虑与反复的咳嗽导致腹肌痉挛、腹肌疲劳引起的，如咳嗽、痰比较少或无痰时，可口服镇咳的药物进行治疗，如咳嗽有痰，痰液粘稠不易咳出时，可加用止咳化痰药物进行辅助恢复。
