婴儿肠炎用抗生素的时间要依据病情而定。要用至孩子临床症状消失，炎症反应指标恢复正常为止，跟疾病的轻重，感染致病菌的毒力等有关。小孩子应用抗菌素要慎重，要有明确的细菌感染的指征。要按照细菌培养的结果选择敏感的抗菌素，病情好转后尽快停药。
长期使用抗生素治疗，会造成体内菌群失调，产生抗药性。偶尔用一次抗生素，对孩子身体健康是不会有什么影响的，不必过于担心。小儿腹泻大多是由饮食因素或肠道炎症感染导致的。应该带孩子到正规医院儿科或消化内科做便常规化验检查，如果是由消化不良等饮食因素导致的，只要服用助消化药物就很好，没有必要使用抗生素治疗。如果是由肠道炎症感染导致的，就需要使用抗生素治疗。
一般情况下，宝宝输抗生素后腹泻不正常。具体情况分析如下：
1.部分儿童对抗生素过敏，有可能会发生消化系统的反应，比如腹泻，平时要多吃一些食物，多吃一些有益于健康的食物。
2.如果长期输抗生素，或是长期使用抗生素，会引起宝宝的肠胃微生态功能失调，从而引起腹泻。
3.使用抗生素进行抗感染，是因为婴儿自身有细菌感染，如果是由于肠道炎症引起的，则会引起肠道炎症和肠粘膜受损，所以不需要使用抗生素。
抗生素和脊椎指压疗法的应用并不冲突。捏脊疗法使用物理和机械刺激来促进血液循环和毒素代谢，这与化学药物疗法并不冲突。如果宝宝有细菌感染，可以症状选择抗生素治疗。同时，你也可以用中医按摩来促进康复。
吃抗生素可能会失眠。
如果平时不失眠，服药后出现这种情况，可能就与服药有关。抗生素引起的失眠可能主要是精神压力造成的，植物调节神经功能有障碍，神经衰弱等原因造成的。植物调节功能紊乱后，可能会出现失眠多梦、睡觉困难、精神不安等症状。这段时间不要压力太大，适当放松。同时适当补钙，可以服用安神健脑液调理，一般停药后可以恢复。
三个月的宝宝如果有细菌感染的话，必须要用抗生素，抗生素可以抗菌消炎，在指导下应用，不能滥用。不到非用不可的地步，就不要用，抗生素对宝宝的危害比较大。在用抗生素之前，一定要到正规医院进行详细的病菌检查，有细菌感染或者支原体感染就可以使用。
