口腔囊肿是不能自愈的。因为口腔囊肿它分为软组织囊肿和颌骨囊肿。软组织囊肿下面又分为几种，颌骨的囊肿又有将近十种，医生会根据口腔囊肿的分类或病人的口腔状态给予不同的手术方案。
腱鞘囊肿不会自愈，需要及时在医生指导下进行治疗，具体分析如下：
腱鞘囊肿是一种囊性肿物，是在关节腱鞘中出现的，通常是因为长期劳损，导致滑膜腔中的滑液增加，最后形成腱鞘囊肿。腱鞘囊肿未经过任何治疗，一般会逐渐变大，也有少部分病人会受到外力的压迫，造成囊肿破裂，包块消失，临床症状减轻。但是由于囊壁还在，这个囊会在将来重新生长。所以在这种情况下，腱鞘囊肿要想完全根治，还是要进行外科手术，将囊壁完全切除。
一般情况下，骶管囊肿是一种囊状的囊状液体，它在骶尾部的硬脊膜囊的破裂中产生。骶管囊肿在临床上是很难根治的，大多数病人在中午、下午长时间久站、久坐都会出现严重的问题。一般采用仰卧姿势，尤其是仰卧式，可以暂时减轻疼痛。
由于骶管囊肿和硬脊膜囊之间有一个单向的阀门，所以很难完全治愈。因此，大多数时候，腰椎囊肿就像是一个很容易愈合的囊袋。如果有明显的临床表现，可以通过神经外科的方式来去除囊肿。
口腔囊肿也是分好多情况，而如果囊肿是牙源性来源的囊肿，是体积比较小，范围比较局限在根尖的附近。经过根管治疗以后，有一部分囊肿是可以自己消失的，是不需要做手术治疗。如果囊肿的体积比较大，或者非牙源形性的，有一些囊肿甚至是x线检查觉得像是囊肿，其实是肿瘤，比如角化囊性瘤，就是以前称为角化囊肿，造釉细胞瘤等之类的肿瘤，就是不会自己消失的，需要尽快做手术。
皮脂腺囊肿常发生在头面部等皮脂腺丰富的部位，不会自己消.易合并感染，主张手术切除。手术是皮脂腺囊肿唯一的治疗方法。手术中可在与囊肿相连的皮肤，尤其是见到导管开口时，沿着皮纹方向设计梭形的皮肤切口，连同囊肿一起摘除。如不常感染.不增大.也可不理它。
