引起阴茎短小的原因主要是阴茎先天性的发育不良，包括包茎，隐匿性阴茎。也有可能是由于海绵体的病变导致海绵体萎缩，海绵体硬化，出现阴茎短小。多见于阴茎外伤，或者是高血压糖尿病。
男性阴茎发育情况如果与正常人的差异很大，那么就需要考虑是否是生殖器畸形。这就需要进一步做性染色体方面的检测。明确是否有假两性畸形或是女性男性化、男性女性化的情况，进一步对症处理。必要的时候可以考虑手术治疗。
阴茎大小和个人体质遗传有关系，正常成人的阴茎在疲软状态下有7-9厘米，勃起以后大概就是11-16厘米。如果疲软状态下小于5厘米，而且勃起时小于10厘米，才能叫阴茎短小。作为大多数男性来讲，性成熟期是18周岁，基本发育就差不多了。
阴茎短小的原因有很多，不仅仅有先天性的原因也有后天性的原因，遗传因素是引起阴茎短小的常见原因，也和体格有一定的关系，一般体格健壮，身材高大的男性生殖器也会发育的大一些，另外在男性出现有隐睾症，内分泌失调，雄性激素分泌不足等的时候都可能会引起阴茎短小。
平常的状态下不能超过四个厘米，或者勃起以后不能超过九个，里面就是一件短小的，需要到医院进行检查明确下诊断，如果确实是有一件短小的情况，还是需要积极的寻找原因。需要进行治疗。
如果想通过食疗来改善阴茎短小的症状，可以多吃狗肉、羊肉、动物内脏、牡蛎、黑芝麻、核桃、坚果等食物，这些食物应该还有一些用处。由于种族、遗传、先天发育和后天发育的影响，每个人阴茎的长度和大小是不同的。
