自身免疫性疾病会出现多次靶器官受累，易损害中枢神经系统。如果自身免疫存在问题，需要调节免疫功能，必要时加用免疫抑制剂。脑炎治疗方案需要神经内科医生在评估病情后予以制定。需要消炎、降颅压。脑炎会有后遗症的。
中医治疗：侧重于一个整体治疗，就是辨证论治、整体观念的问题，用中药来治是一个全身的一个调节，包括各种的功能障碍，根据用药的处方的加减来全身的调节，另外比如针灸方面也是可以，就是针对不同的功能障碍。
脑梗死后遗症会出现肢体障碍，言语障碍等症状。可以服用脑心通进行调理，具体用药谨遵医嘱，可以在专业的康复师指导下进行运动治疗，作业治疗，言语治疗，水疗等康复训练的。同时要配合进行针灸，推拿等中医治疗。
面神经炎后遗症根据病情进行治疗的，到中医科就诊一下，可以使用针灸、理疗和按摩治疗，进行面部肌肉康复锻炼，口服营养神经药物维生素治疗，平时注意休息，避免劳累，饮食避免辛辣和油腻。
头癣治疗有后遗症。
头癣是一种慢性传染病，主要是由于皮肤癣菌所致，会影响到头皮和毛发。头癣分为黄癣、白癣、黑点癣、脓癣四大类。在这些症状中，黄癣的病程可以是一个长期的过程，在病情痊愈后，会出现皮损和周边的皮肤出现萎缩性疤痕和永久的脱发；白癣的发病时间比较久，但是不会留下光头或疤痕；黑点癣是一种发内的炎症，一旦痊愈，就会留下光头和萎缩的疤痕。
宝宝做腰穿可能会有后遗症。
小儿腰穿是一种较为成熟的检查手法，而腰穿手术是一种创伤性的手术，有可能会导致手术失败，也有可能会导致出血、感染、脑脊液压力过低、头疼等后遗症。不过只要是经过正规的操作，一般都不会有后遗症。因此，如果需要进行腰穿，家长要注意选择正规的医院，并且由专业的医生进行操作，以尽可能地降低宝宝出现后遗症的风险。
