附睾囊肿是因为性刺激，或感染因素引起的，也可能是精子的管道不通畅引起的。常常表现为睾丸胀痛，坠胀感。患处常常表现为有肿块。如果症状不明显，没有发展的趋势，不需要治疗。
比较小，单一的附睾囊肿是不需要治疗的，如果是比较大的囊肿，或者短时间内增大的囊肿，或者是多发的附睾囊肿可以考虑手术进行切除，一般是手术过程中用蚊式钳分离附睾囊肿，把囊壁完全切除即可。
附睾囊肿，其发病原因可能系输精管阻塞而导致精液积聚。平时毫无症状，则无需治疗，一般对今后的生育及性生活没有影响。手术切除有可能破坏附睾管而影响生育，故对未婚病人宜慎重。尽量戒除烟酒，少吃辛辣刺激食物。
附睾囊肿的治疗方法比较多，如果是轻微不适那可以吃一段时间中药来看看效果。但是如果囊肿大，或者出现了严重的并发症等，那一般建议做手术来治疗会比较好，否则会影响到正常的性生活的。
手术一般是没有问题的，附睾头囊肿手术切除多余的囊肿并不是切除附睾，囊肿是属于良性病变，要先进行穿刺抽液，附睾及附睾囊肿切除后，后续应该配合消炎消肿治疗。平时要多卧床休息。