扁平疣治疗上可以用物理疗法或药物疗法、中医中药疗法等。物理治疗主要选用液氮冷冻和激光治疗、疣组织包埋疗法。中医中药疗法有耳后放血法、火针法、穴位注射法等。药物治疗可以服用增强免疫的药物，因为扁平疣多发生于免疫力低下人群，免疫力增强后，有自身清除病毒的可能，扁平疣是有自愈性的。
扁平疣是皮肤科常见的病毒感染类疾病，女性扁平疣是感染了人类乳头瘤病毒导致。
患者感染通常是用手接触到了扁平疣病毒，在搔抓刺激皮肤，尤其是皮肤有破溃的情况下，病毒接种到皮损部位，会引起病毒在局部接种，引起皮损的出现。如果护理不当，比如在面部时，进行搔抓，或者是用毛巾使劲的擦拭，导致毛巾上有病毒，引起病毒的接种，引起数目的增多。如果机体的抵抗力较差，另外皮肤有破损，病毒定植接种在局部而引起。
扁平疣主要是由于人类乳头状瘤样病毒感染导致的。所以可能是由于不小心感染了这个病毒而导致长扁平疣。治疗方面可以用激光或者冷冻的方法，把局部的扁平疣的祛除掉，然后可以涂抹治疗，预防局部的复发。
扁平疣好发青少年，又叫青年扁平疣，扁平疣常是突然发生，患者会发现面部、颈部、手背、胸部或是前臂等处出现数个表面光滑、质地却硬的圆形或是椭圆形甚至多角形的米粒至黄豆大小的扁平丘疹，而这种扁平丘疹常常的颜色呈现出正常肤色或是淡褐色。一旦确诊扁平疣，一定不能搔抓，否则，扁平疣会因经常搔抓，而沿着抓痕出现串珠状排列。
扁平疣是病毒感染导致的，可以通过搔抓而自身接种，从而越来越多。但在人群中的互相传播能力比较弱，日常接触是不会传染的。如果自己的皮肤有破损再接触到患者的皮损破口处，有可能会传染。建议不要和患者共用毛巾、搓澡巾等。
扁平疣形态为米粒至绿豆样大小的扁平隆起的丘疹。
扁平疣好发于青少年，形态为米粒至绿豆样大小的扁平隆起的丘疹，表面比较光滑，触摸时质地较硬，呈浅褐色或正常皮肤色，为圆形，椭圆形或多角形。扁平疣的数目比较多，大多数扁平疣密集分布。如果搔抓皮肤后，会在搔抓处出现扁平疣的皮损。扁平疣一般没有自觉症状，少数患者会有瘙痒的症状。好发于面部，手背以及前臂等处。扁平疣的病程一般是慢性，有的可以持续多年，有时候也会突然自行消失。
扁平疣可以通过口服药物进行调理。因为从口腔到五脏六腑的消化过程中，会有大量的药物流失，无法杀死病菌，因此，这种药物的作用并不是很好，而且需要数十日的时间，普通人根本无法承受。扁平疣可以通过激光切割。因为扁平疣是在皮肤表层，因此，雷射只能清除表层的扁平疣，而不是清除皮下的病毒，因此无法从根本上治愈，通常数个月后，它又会再次出现。
