怀孕后如果是空囊，就是胚胎停育了，胚胎停育后有可能当时就会流掉，也可能不能自行流出，需要做人工流产手术。空孕囊是胚胎停育，不会长大的，如果检查孕囊发育不好，胚胎停育，需要抓紧时间上医院做人流手术，胚胎停育后容易引起出血等症状。
通常情况下，怀孕40天的患者能做流产。具体情况分析如下：
怀孕40天的患者如果做药物流产药物流产，一般是指在停经49天之内，患者可以按照医嘱使用米非司酮片、米索前列醇片等药物进行流产，先使体内的孕酮活力下降，进而引起流产，再通过药物使子宫剧烈收缩，将妊娠组织排出体外的一种流产方式，因此怀孕40天的患者能做流产。
胎儿停止发育是指胚胎本身有缺陷或由于发育过程中的不利因素而停止发育。有些人没有明显的症状，只有通过b超才能发现。空妊娠囊也属于胎儿停止，不需要胎儿停搏。否则，宫腔内死产可能导致感染等。建议在主治医生的指导下进行处理，注意查明胎儿停搏的原因，及时治疗后考虑妊娠。
这可能是习惯性流产造成的，可能是由于胚胎本身发育不好，自然死亡，也有可能是由于激素分泌不足难以支持胚胎发育而造成死亡，所以尽快去医院先找出习惯性流产的病因，然后治疗后再考虑怀孕比较好。
怀孕早期五十天左右，应当出现胎心胎芽，如果到50天还没有胎心胎芽，并且也没有卵黄囊，考虑这是空孕囊，往往是孕囊发育有缺陷的缘故。避免环境过于高温，低温寒冷刺激，或者是噪音，远离环境污染。
怀孕40天进行流产后是否需要清宫要根据流产后复查结果判断。
怀孕40天进行药物流产或人工流产都可以，两者没有本质区别，安全性较高，残留率较低。通常流产后大概两周要复查B超，看宫腔内有无残留。
第一，若有体积小于3cm以下的实性残留或少量液性暗区，血流不丰富的情况，可口服药物促进宫缩，或等来月经，通过月经大部分都可排出体外。
第二，若宫腔内残留无法通过上述方法排出，或残留的体积较大，血流丰富的情况下就需要进行清宫。
