是可以进行手术的方法来治疗的，但是手术治疗存在风险，所以患者一定要考虑好风险的，再选择做或不做，这种外科手术可能不慎破坏阴茎的神经和血管，这将可能导致无法勃起以及龟头没有快感。也可能出现术后感染的并发症。
手术治疗阴茎短小会带来局部的不稳定，有可能损伤局部神经血管，带来阴茎勃起困难等后遗症，冠状沟部位注入大量脂肪或人工材料，会形成一种畸形外观，且有些假体会带来明显不适。
病因复杂。物理治疗：物理治疗放的方面就是在于不用吃药，不用做手术，每天在家里没人的时候做一下保健按摩就行了，但是并不是所有人都适用，这只适用与范围较小，适用于年龄较小，由于体质原因还没有完全成长完毕的人，而且按摩的时候患者一定要把心态放平淡，不要心猿意马。
阴茎大小和个人体质遗传有关系，正常成人的阴茎在疲软状态下有7-9厘米，勃起以后大概就是11-16厘米。如果疲软状态下小于5厘米，而且勃起时小于10厘米，才能叫阴茎短小。作为大多数男性来讲，性成熟期是18周岁，基本发育就差不多了。
可以吃的，阴茎短小并没有忌口，只需要忌烟酒，而且红薯含有大量的膳食纤维、胡萝卜素、维生素A、B、C、E以及钾、铁、铜、硒、钙等多种微量元素，营养价值非常高，被营养学家们称为营养最均衡的保健食品。
阴茎短小除了手术的治疗方法，这是要看个人的年龄和身体状况来决定的。如果阴茎已经发育成熟了，不手术不能治疗，只能采用阴茎延长术治疗。在这期间要注意饮食规律，保证足够的睡眠。
