一般情况下，儿童患有脑炎会引起眼睛疼痛。具体分析如下：
通常来讲，儿童在感染了病毒、细菌、真菌引起的脑炎后，会导致颅内压增高，从而出现头痛、呕吐、嗜睡、发热、抽搐等症状。尤其是儿童颅内压增高以后会引起儿童眼睛胀痛，需要及时给予儿童降颅内压治疗，如甘露醇等。另外，还需要进行抗感染治疗，因为脑炎是导致儿童脑炎颅内压的主要原因，只有控制炎症，才能根治颅内压增高。
儿童颈椎半脱位通常较为疼。
颈椎半脱位主要是指颈椎的椎体之间的小关节发生了轻度的移位。一般来讲分为侧方脱位以及前方脱位。儿童颈椎半脱位会出现疼痛症状，主要表现为颈部脱位部位的疼痛，颈部后方棘突位置的压痛。颈椎半脱位与外伤撞击有一定的关系。除了疼痛之外，还会影响颈部的活动，导致颈部活动受限，颈椎旋转受限。
若儿童年龄较大，能准确表述疼痛部位，要立即带孩子到医院儿科就诊。导致头疼的原因很多，要根据具体情况判断。
若是没休息好、吹风、不小心撞到头等原因导致的头痛，或感冒、患有鼻窦炎等都会导致头痛，这类疼痛问题不大。较严重的可能是颅内占位性病变、脑炎、脑血管畸形等原因导致的，要通过检查明确判断。建议检查磁共振，大多数疾病都能检查出来，没有问题则可以放心，检查有异常可以避免耽误治疗。
如果只是龋齿，比较浅，不会有痛的。如果龋齿较深，已经挨近神经了，那做治疗就会出现疼痛，需要在麻醉下操作，如果牙髓已经坏死了，那就再深的龋齿，也已经没感觉了，也不会疼痛了。
小儿头疼与原发性头疼综合症和继发体的病症有关，建议及时去医院就诊，明确具体情况，对症治疗。
原发头疼以偏头疼、神经痛及群聚头疼为特征。继发头疼一般与急性发热性病变、中枢神经系统感染、占位性病变等因素有关。而小儿头疼，一般都是因为一些比较严重的基础疾病，大部分都是因为病毒、上呼吸道感染等原因造成的，例如：流感，鼻炎，鼻窦炎等。
