一般情况下，射完精后阴茎疼痛的原因可能是精囊炎，睾丸附睾炎等。
1、精囊炎：精液通过尿道射出体外之前会从睾丸附睾进入输精管、射精管。当精囊有炎症的时候，在阴茎的内部的尿道就会出现射精疼痛的现象。
2、睾丸附睾炎症：精液里面有白细胞、红细胞导致，会刺激阴茎出现疼痛的症状。为了明确病情，及时治疗，建议及时去医院进行相关检查，如做睾丸附睾彩超和精液分析。
尿频尿急尿痛属于一种膀胱刺激症状，多见于急慢性尿路感染所致的膀胱炎。可以服用点抗生素之类的药物来治疗，治疗期间注意多喝些水，多排尿，平时要多喝热水，多吃蔬菜水果，注意个人卫生。
在排尿的时候，才会出现疼痛，那么可能就是属于一个尿痛的症状的了，出现了表现，还是要注意，是不是泌尿系统感染的问题导致的了。要注意尿道炎的问题导致的了，可以考虑化验一下尿液的，是可以帮助明确的了。
应该考虑是由尿道炎导致的，当身体抵抗力低，再加上久坐久站，受凉或不注意阴部清洁卫生的时候，就特别容易发生尿路炎症感染，引起尿道疼痛。不要积食得当，使用奎洛酮类消炎药或药物类消炎药治疗，然后多喝水，忌生冷辛辣等刺激性食物，戒烟戒酒，是很快就能够治好的。
阴茎疼痛一般由于外伤，炎症感染刺激，或者包皮长，包茎，系带短等都会引起的，可以到院做个科学检查明确一下病因，对症进行治疗，平时注意卫生清洁，不要吃辛辣刺激性食物，多喝水，不要憋尿。