预防肛瘘首先养成良好的排便习惯，每日排便后坐浴保持肛门清洁，对预防感染有积极作用。建立正常的膳食习惯，因肛瘘的发生与湿热有关，对于油腻饮食，可以内生湿热，所以不宜多吃。
手术以后的饮食就非常重要，首先要进食容易消化的食物，多吃水果和蔬菜，尽量保持排稀便，纠正便秘，适当的进行功能锻炼。并且要避免暴饮暴食，每次在排便之后要及时的进行清洗，并且找医生进行换药。
肛瘘进行手术后，是比较简单的肛瘘，住院10天左右就可以恢复，如果是比较复杂的肛瘘可能20天左右才可以恢复，在恢复期间每天都需要消毒、清洗、换药才可以加快恢复速度。
注意饮食卫生，忌食辛辣刺激性食物，如酒，葱，大蒜，辣椒等；清淡饮食，宜多食清淡易于消化的食物以及新鲜水果和新鲜蔬菜；多食含纤维素丰富的食物，如青菜，竹笋等；少食鱼，虾，蟹等发物及油煎熏烤的食物；如大便干结可在医生指导下口服通便的药物。
大便时不可突然排出，以免伤口因受到外力骤然改变而出现剧烈的疼痛症状。在大便前可在伤口表面及肛门涂抹软膏，以减轻大便对伤口的摩擦和刺激，大便后应当及时保持局部清洁。
