无痛胃镜和无痛肠镜是能够一起做的，特别适用于不明原因的黑便等。在进行无痛胃肠镜检查之前首先进行心肺功能测定，以评估患者能否耐受，特别是对于既往有心肺基础疾病的老年患者尤为重要。
但是应当注意的是，同时进行胃镜和肠镜检查，检查的时间就会延长，对患者的耐受力也是一种考验。还会增加患者的肝肾负担。如果患者身体素质不是特别好，建议分开进行。
无痛胃镜和普通胃镜都有一定的风险，但是无痛胃镜的风险相对更高。
无痛胃镜和普通胃镜都是一种侵犯性的检查，是一种有创的检测方法，都存在一定的风险。无痛胃镜疼痛感较轻，也不会引起咽部对抗反，但是无痛胃镜的病人，可能会因为芬太尼和异泊酚的作用而陷入深度睡眠迷，出现抑制呼吸的现象，在检测的时候，会发生误吸和坠积性的肺炎。因此，无痛胃镜的风险相对更高。
通常来说，无痛胃镜、肠镜能一起做。
胃镜和肠镜是可以同时进行的，因为这两种检测的位置不同，所以不会有任何的矛盾。为了避免出现意外情况，在检查之前，患者需要做好万全的准备。通常情况下，做肠镜的时候，要在四个钟头之前吃泻剂来清除肠道。通过心电图、血常规等检查来确定病人的耐受性。没有任何问题，可以一次完成两个项目。
无痛胃镜肠镜有危险，具体分析如下：
首先，就是麻醉的风险，虽然是速效麻醉剂，但如果用药不当，很可能会出现精神错乱、烦躁、缺氧缺血性脑病、植物状态、死亡等。另外，与普通胃肠镜相比，因为缺乏沟通，所以在手术中，肠镜会出现充气过多、进镜速度过快，从而增加肠穿孔和系膜的过度牵扯。这就要求有熟练的麻醉师和内窥镜医生配合，才能进行无痛胃肠镜检查。
痛胃镜的副作用是比较小，主要是对咽喉部和消化道黏膜的损伤。无痛胃镜和普通胃镜的区别是无痛胃镜是在全麻的情况下进行，患者感觉不到痛苦，胃镜的前端穿越咽喉部时没有抵抗，减轻了对局部组织的损伤，但是也会对消化道黏膜造成轻度的损伤。
患者需要注意的是，应在专业医生的指导下进行检查，在生活当中也应当注意，不要过度的情绪激动，不要吃热性的食物，多吃蔬菜水果。
无论是无痛胃镜还是普通胃镜，都存在着一定的危险性，而且会对身体产生一定的危害。因为无痛胃镜是在全身麻醉下行进行的，因此有可能会引起恶心、呕吐、呼吸困难等副作用，因此在做检查之前应该先禁食水8个小时。此外，在检查时，可能会对胃、食道、十二指肠粘膜造成损伤，甚至有可能造成食道、胃、十二指肠粘膜破裂出血。
