卵巢囊肿分和病理性，生理性的可随生理周期的变化可以自然消失。由于疾病生成的病理性的囊肿，往往需要手术来明确诊断并作相应的处理。有囊肿时先要检查确定为生理还是病理性，再做处理。病理性的卵巢囊肿做微创手术，术后两周就可以恢复了，若是做开腹手术，需要休息一个月才可以恢复。
卵巢囊肿的治疗时间要根据病情的严重性来定，长期的饮食结构，生活习惯不好等因素造成体质过度酸化，引起代谢循环变慢，造成卵巢疾病和内分泌失调，免疫功能下降，从而发展为卵巢组织异常增生，终致卵巢囊肿。卵巢囊肿一般内科保守治疗是没有什么效果的，一般建议手术治疗。
卵巢囊肿需要治疗1个月时间。最常见的治疗方法主要包括药物治疗和手术治疗的方法，由于药物疗法具有一定的局限性，大部分还是要采用手术的方法进行治疗。如果囊肿直径小于5cm，没有明确症状可以不用管。
卵巢囊肿术后恢复时间与年龄、体质、囊肿严重程度等有关，囊肿手术属于破坏性手术，为完全切除，一般恢复相对较快。一般7天可出院。卵巢囊肿术后需进行适度活动，避免粘连。卵巢囊肿可进行腹腔镜微创手术，术后应用防止粘连的药物，利于术后康复。此外需注意补充营养，充分休息，勿食生冷食物，保持良好心情，定期复查。
卵巢囊肿术后3-4天就恢复的比较好了，就可以出院了。半个月以后就可以进行少量的运动，适当的做一些家务。3个月以内不要进行重体力劳动，术后注意保暖，尤其是经期要注意小腹保暖。
一经确诊应尽快手术治疗，超过5CM必须手术否则随时都有发生破裂或蒂扭转的可能而危及生命，至少是三个月到半年后，因为损伤细胞的修复期是90—120天。定期去复查一下，因为卵巢囊肿手术多少都会对卵巢有些损伤。
